More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0253 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  100 
 
 
367 aa  759    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  64.58 
 
 
370 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  63.76 
 
 
371 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  58.58 
 
 
361 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  51.37 
 
 
364 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.34 
 
 
360 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  48.34 
 
 
371 aa  359  5e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.69 
 
 
360 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  48.76 
 
 
365 aa  352  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.24 
 
 
360 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.24 
 
 
360 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.22 
 
 
364 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.91 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  51.38 
 
 
372 aa  338  8e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  49.31 
 
 
366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  44.04 
 
 
357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.96 
 
 
441 aa  322  6e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  48.9 
 
 
367 aa  322  9.000000000000001e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.51 
 
 
366 aa  318  7e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  42.58 
 
 
360 aa  318  7e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.78 
 
 
366 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  42.98 
 
 
365 aa  318  9e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  45.48 
 
 
366 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.23 
 
 
366 aa  316  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.26 
 
 
381 aa  317  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.23 
 
 
366 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.23 
 
 
366 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.23 
 
 
366 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.23 
 
 
366 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.58 
 
 
368 aa  316  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.17 
 
 
364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.96 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.96 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.96 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.09 
 
 
364 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.11 
 
 
366 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.62 
 
 
363 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.62 
 
 
363 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.86 
 
 
359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.19 
 
 
360 aa  309  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  46.99 
 
 
375 aa  309  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.92 
 
 
362 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.16 
 
 
376 aa  308  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  45.41 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  46.28 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  45.86 
 
 
369 aa  302  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  45.8 
 
 
375 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 
369 aa  301  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.06 
 
 
363 aa  300  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  47.51 
 
 
351 aa  300  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.8 
 
 
362 aa  299  5e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  48.07 
 
 
374 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.54 
 
 
363 aa  296  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.69 
 
 
372 aa  295  8e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.01 
 
 
380 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  41.48 
 
 
364 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.93 
 
 
403 aa  292  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.25 
 
 
430 aa  292  7e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  43.35 
 
 
378 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.9 
 
 
370 aa  290  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.82 
 
 
368 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.74 
 
 
360 aa  288  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.82 
 
 
368 aa  288  8e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.39 
 
 
369 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.39 
 
 
369 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  43.28 
 
 
381 aa  285  8e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.01 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.97 
 
 
381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  42.82 
 
 
381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  42.56 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.29 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.86 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  41.71 
 
 
360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.54 
 
 
365 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  43.58 
 
 
379 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3592  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.32 
 
 
359 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00861  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.19 
 
 
359 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  45.56 
 
 
350 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.29 
 
 
365 aa  278  8e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  43.56 
 
 
363 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  43.25 
 
 
356 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 
365 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.73 
 
 
369 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.63 
 
 
369 aa  275  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 
372 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  44.11 
 
 
364 aa  275  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.11 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.37 
 
 
362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  38.75 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.75 
 
 
365 aa  273  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.89 
 
 
375 aa  273  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3675  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.67 
 
 
364 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3151  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.16 
 
 
364 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000770906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.4 
 
 
382 aa  269  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  46.49 
 
 
363 aa  269  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1274  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.12 
 
 
362 aa  268  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2721  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.16 
 
 
364 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0309145  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  43.25 
 
 
372 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.44 
 
 
374 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>