More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2455 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 363 aa  743    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.53 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.83 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.88 
 
 		 366 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.15 
 
 		 366 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.15 
 
 		 366 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.15 
 
 		 366 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.88 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.88 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.88 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.88 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.88 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.88 
 
 		 366 aa  308  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.88 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.32 
 
 		 368 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  47.75 
 
 		 369 aa  302  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.81 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  44.57 
 
 		 365 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  45.86 
 
 		 367 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.53 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  43.8 
 
 		 371 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  45.6 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  43.14 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  43.99 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.44 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  43.97 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.75 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.8 
 
 		 364 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  44.08 
 
 		 391 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.74 
 
 		 374 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  42.3 
 
 		 371 aa  288  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  45.43 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  42.9 
 
 		 364 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 		 381 aa  284  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.21 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  42.82 
 
 		 372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  43.46 
 
 		 401 aa  282  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  43.02 
 
 		 366 aa  282  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.22 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.88 
 
 		 372 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.53 
 
 		 376 aa  279  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  42.31 
 
 		 375 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  43.56 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.02 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.84 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.84 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  41.69 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  41.42 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.9 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  44.57 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.25 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.26 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.11 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.47 
 
 		 372 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.33 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0537  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.15 
 
 		 382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.53 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.72 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1780  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.22 
 
 		 370 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.7 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  44.13 
 
 		 372 aa  265  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.2 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.42 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  42.05 
 
 		 379 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  42.7 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  41.07 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.22 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.34 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  39.34 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.94 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  38.72 
 
 		 365 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.6 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.4 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  42.42 
 
 		 375 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.56 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.4 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.48 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.14 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.73 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.44 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  43.38 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  42.46 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  38.21 
 
 		 378 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.39 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.59 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02950  aminomethyltransferase  40.16 
 
 		 388 aa  249  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  39.61 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.38 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  40.62 
 
 		 357 aa  247  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.96 
 
 		 368 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.94 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  38.61 
 
 		 364 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>