More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0599 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 362 aa  749    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  73.61 
 
 		 359 aa  549  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.11 
 
 		 360 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.88 
 
 		 360 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.43 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  61.05 
 
 		 364 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.61 
 
 		 369 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  60.28 
 
 		 360 aa  455  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.91 
 
 		 369 aa  425  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  48.48 
 
 		 357 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  49.86 
 
 		 364 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.24 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.81 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  46.58 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.54 
 
 		 360 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  46.2 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.98 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.86 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.24 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.73 
 
 		 364 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  47.38 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 		 366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  42.47 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.18 
 
 		 441 aa  309  4e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  41.92 
 
 		 367 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  44.48 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  41.64 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.35 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.35 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.35 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.35 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.35 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.43 
 
 		 368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  46.41 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.35 
 
 		 366 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.98 
 
 		 364 aa  298  7e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  44.08 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  44.2 
 
 		 351 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.15 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.73 
 
 		 430 aa  292  7e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  43.65 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.22 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.22 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  43.87 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.35 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.26 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.82 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.03 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  40.98 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  42.27 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  40.5 
 
 		 361 aa  272  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 		 366 aa  268  8e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.18 
 
 		 365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.13 
 
 		 375 aa  266  4e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.61 
 
 		 363 aa  265  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.45 
 
 		 365 aa  265  8e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  40.83 
 
 		 362 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.36 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.8 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.08 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  39.61 
 
 		 367 aa  259  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  40 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  37.74 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.3 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  39.67 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  38.96 
 
 		 378 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  40.33 
 
 		 361 aa  257  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  41.97 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  38.61 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.29 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  36.41 
 
 		 374 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.29 
 
 		 368 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.96 
 
 		 369 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.96 
 
 		 369 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  38.04 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.41 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.83 
 
 		 374 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  39.78 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  38.67 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0375  glycine cleavage system T protein  38.61 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.39 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.199307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.04 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  37.78 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  38.78 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  36.11 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  40.44 
 
 		 363 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.44 
 
 		 372 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.44 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  36.13 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  37.74 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  41.89 
 
 		 380 aa  238  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  37.03 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  35.91 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.19 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>