More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1587 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  100 
 
 
363 aa  735    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  67.59 
 
 
363 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  67.5 
 
 
362 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0375  glycine cleavage system T protein  67.5 
 
 
362 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0395  glycine cleavage system T protein  67.04 
 
 
363 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  64.72 
 
 
366 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  66.2 
 
 
363 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  43.73 
 
 
360 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  44.6 
 
 
367 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1403  glycine cleavage system T protein  46.24 
 
 
376 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  47.79 
 
 
362 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  43.33 
 
 
360 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  42.86 
 
 
359 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.42 
 
 
360 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.48 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 
364 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.85 
 
 
360 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.74 
 
 
360 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  42.18 
 
 
357 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.57 
 
 
360 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.48 
 
 
368 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  37.71 
 
 
360 aa  264  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.94 
 
 
369 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  38.9 
 
 
371 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.83 
 
 
359 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.78 
 
 
360 aa  258  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.84 
 
 
430 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.59 
 
 
441 aa  256  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  38.61 
 
 
365 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  36.01 
 
 
365 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  41.16 
 
 
361 aa  251  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  40.95 
 
 
371 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.74 
 
 
364 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  37.4 
 
 
364 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  38.89 
 
 
370 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
370 aa  247  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  41.69 
 
 
375 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  39.04 
 
 
361 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  35.91 
 
 
364 aa  245  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.56 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  40.5 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  41.16 
 
 
370 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.11 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.12 
 
 
363 aa  239  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  42.74 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
362 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  40.95 
 
 
366 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  39.72 
 
 
366 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  37.02 
 
 
366 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.36 
 
 
366 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.09 
 
 
366 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.33 
 
 
364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  39.05 
 
 
379 aa  236  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  40.17 
 
 
367 aa  235  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.13 
 
 
360 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  42.46 
 
 
372 aa  235  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.09 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.09 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  36.31 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.34 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  38.42 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.81 
 
 
366 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.81 
 
 
366 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.81 
 
 
366 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.81 
 
 
366 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.81 
 
 
366 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  38.13 
 
 
381 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  39.39 
 
 
408 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.94 
 
 
362 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  36.93 
 
 
373 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.67 
 
 
365 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.52 
 
 
372 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.67 
 
 
375 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  38.15 
 
 
373 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  38.9 
 
 
378 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  39.73 
 
 
376 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  36.27 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  39.83 
 
 
367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.81 
 
 
366 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.07 
 
 
375 aa  224  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  39.45 
 
 
376 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  37.94 
 
 
369 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.74 
 
 
369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.74 
 
 
369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  36.39 
 
 
363 aa  222  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  41.26 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  39.81 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  36.49 
 
 
373 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
365 aa  219  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  36.41 
 
 
373 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  37.26 
 
 
381 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.08 
 
 
363 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.08 
 
 
363 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.22 
 
 
362 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.94 
 
 
365 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.67 
 
 
363 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.34 
 
 
374 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  38.16 
 
 
369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>