More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1868 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 368 aa  732    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104311  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  64.29 
 
 		 379 aa  455  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2939  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.67 
 
 		 369 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  65.22 
 
 		 364 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  65.22 
 
 		 364 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  65.31 
 
 		 372 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  65.22 
 
 		 364 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3071  glycine cleavage system T protein  64.84 
 
 		 372 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  63.86 
 
 		 366 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3574  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  64.72 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0601666  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.53 
 
 		 369 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1782  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.11 
 
 		 365 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3548  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.37 
 
 		 374 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.033061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  64.27 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0347978  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  63.99 
 
 		 369 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.19 
 
 		 387 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2307  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.94 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.26 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  40.17 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  41.71 
 
 		 375 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  41.76 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.19 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  39.89 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  41.87 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  40.11 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  38.67 
 
 		 357 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  45.3 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.4 
 
 		 366 aa  252  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.59 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.67 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.67 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  40.71 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.96 
 
 		 441 aa  250  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.4 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  39.13 
 
 		 361 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.57 
 
 		 364 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.22 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  39.24 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  34.99 
 
 		 360 aa  246  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  43.96 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.81 
 
 		 360 aa  246  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.37 
 
 		 365 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.96 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  41.32 
 
 		 371 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.32 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.32 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.59 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  42.06 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.91 
 
 		 362 aa  243  6e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.63 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.33 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.39 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.42 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  39.39 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  34.63 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.48 
 
 		 363 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  41.21 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  35.85 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  39.62 
 
 		 367 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.39 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.39 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.36 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.53 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.07 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  42.94 
 
 		 364 aa  225  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.89 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  36.68 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1120  glycine cleavage system T protein  43.83 
 
 		 349 aa  224  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  43.92 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.69 
 
 		 363 aa  222  6e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.21 
 
 		 365 aa  222  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.01 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.51 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3293  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.74 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1274  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.17 
 
 		 362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0143  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.21 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228599  normal  0.397791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.79 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3160  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.05 
 
 		 375 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.94655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3487  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.74 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.3 
 
 		 370 aa  219  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  40.37 
 
 		 381 aa  219  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0145  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.43 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.731192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3255  glycine cleavage system T protein  41.53 
 
 		 584 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  36.24 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.51 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  41.87 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3480  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.62 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  37.47 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0246  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.56 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.42 
 
 		 363 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.72 
 
 		 372 aa  215  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.77 
 
 		 368 aa  215  9e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>