More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1892 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 
363 aa  724    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  61.29 
 
 
374 aa  448  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  60.88 
 
 
365 aa  442  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.69 
 
 
390 aa  414  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.199307 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  55.77 
 
 
366 aa  388  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  40.6 
 
 
357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  39.95 
 
 
371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.84 
 
 
360 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.4 
 
 
364 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  39.3 
 
 
364 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  38.32 
 
 
367 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.16 
 
 
364 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.69 
 
 
363 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.69 
 
 
363 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  40.87 
 
 
370 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.05 
 
 
360 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.88 
 
 
363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  36.24 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.32 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.78 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  38.01 
 
 
371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.46 
 
 
369 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  40.49 
 
 
371 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.74 
 
 
368 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.07 
 
 
359 aa  250  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.28 
 
 
362 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.86 
 
 
370 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  38.38 
 
 
365 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
366 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
366 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  38.01 
 
 
364 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 
366 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 
366 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 
366 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.74 
 
 
363 aa  245  9e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
366 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.04 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  41.99 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.59 
 
 
369 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  44.54 
 
 
372 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.46 
 
 
365 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.51 
 
 
364 aa  240  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  41.88 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  38.29 
 
 
361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.31 
 
 
360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.67 
 
 
364 aa  239  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02950  aminomethyltransferase  40.87 
 
 
388 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
366 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.23 
 
 
362 aa  236  6e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.4 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.54 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.52 
 
 
360 aa  233  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.78 
 
 
376 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  40.87 
 
 
363 aa  233  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  41.88 
 
 
381 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  40.11 
 
 
366 aa  232  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  35.87 
 
 
365 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.1 
 
 
362 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.67 
 
 
381 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  35.75 
 
 
366 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  40.7 
 
 
391 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.86 
 
 
369 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.84 
 
 
363 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  39.06 
 
 
389 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  41.46 
 
 
364 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  39.78 
 
 
367 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.5 
 
 
369 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.5 
 
 
369 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.79 
 
 
441 aa  226  6e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.25 
 
 
375 aa  225  9e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  39.01 
 
 
351 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.13 
 
 
365 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  40.27 
 
 
366 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  40.64 
 
 
381 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  39.22 
 
 
401 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.12 
 
 
381 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.17 
 
 
380 aa  222  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  37.43 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  40.11 
 
 
369 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.3 
 
 
372 aa  220  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  39.12 
 
 
350 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  42.01 
 
 
372 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.77 
 
 
374 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  38.48 
 
 
369 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2463  aminomethyltransferase  38.34 
 
 
363 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27536  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  37.6 
 
 
375 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  41.92 
 
 
374 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.68 
 
 
365 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.93 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  37.4 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.42 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.58 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.15 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.99 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>