More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1647 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 
381 aa  781    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  68.35 
 
 
376 aa  541  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  69.4 
 
 
369 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  69.4 
 
 
369 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.66 
 
 
381 aa  494  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  64.36 
 
 
378 aa  488  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  56.45 
 
 
375 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.8 
 
 
372 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.4 
 
 
374 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.92 
 
 
375 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.37 
 
 
365 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.27 
 
 
372 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.46 
 
 
372 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.86 
 
 
359 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.98 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.98 
 
 
360 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.7 
 
 
360 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.73 
 
 
360 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  46.13 
 
 
372 aa  312  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  44.96 
 
 
367 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.75 
 
 
364 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.01 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.35 
 
 
370 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  42.9 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.21 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  43.97 
 
 
367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  42.29 
 
 
371 aa  302  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1780  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.73 
 
 
370 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.8 
 
 
363 aa  300  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.19 
 
 
370 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.96 
 
 
366 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.96 
 
 
366 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.96 
 
 
366 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
366 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  40.33 
 
 
357 aa  295  7e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.12 
 
 
366 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.12 
 
 
366 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.12 
 
 
366 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.12 
 
 
366 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.12 
 
 
366 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  42.82 
 
 
370 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.58 
 
 
366 aa  292  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  41.53 
 
 
364 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.48 
 
 
364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 
364 aa  285  8e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.16 
 
 
370 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.51 
 
 
363 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.85 
 
 
366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  41.92 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.48 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.48 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  40.27 
 
 
365 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.44 
 
 
441 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  41.8 
 
 
381 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  40.27 
 
 
366 aa  279  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.84 
 
 
368 aa  278  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.92 
 
 
369 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  40.51 
 
 
389 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.73 
 
 
430 aa  275  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0500  glycine cleavage system T protein  42.82 
 
 
371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  41.46 
 
 
360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.72 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  40.27 
 
 
361 aa  272  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.32 
 
 
368 aa  269  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.22 
 
 
380 aa  269  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  43.45 
 
 
351 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.66 
 
 
362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.05 
 
 
368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  38.59 
 
 
363 aa  266  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.55 
 
 
370 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0331  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.71 
 
 
365 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3437  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.55 
 
 
366 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  39.95 
 
 
375 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  42.55 
 
 
374 aa  262  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0316  glycine cleavage system T protein  41.18 
 
 
360 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1904  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.74 
 
 
383 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.48 
 
 
383 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00965774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.56 
 
 
360 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 
369 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.51 
 
 
369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 
360 aa  258  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  40.77 
 
 
364 aa  258  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  42.3 
 
 
350 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3325  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.96 
 
 
372 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  40.6 
 
 
365 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.34 
 
 
359 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  40.33 
 
 
356 aa  256  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0133  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.96 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0246  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.64 
 
 
360 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.94 
 
 
362 aa  255  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 
360 aa  255  7e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3880  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.21 
 
 
372 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  38.48 
 
 
360 aa  255  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.63 
 
 
365 aa  255  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3064  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.92 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0393389  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.25 
 
 
362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3303  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.95 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00589278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1190  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.33 
 
 
360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68870  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.66 
 
 
360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0159  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.69 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>