More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6885 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  91.68 
 
 		 853 aa  1654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  97.89 
 
 		 853 aa  1741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  82.53 
 
 		 853 aa  1511    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 853 aa  1766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.39 
 
 		 838 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  37.72 
 
 		 840 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.74 
 
 		 821 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.65 
 
 		 830 aa  369  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 812 aa  361  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  31.52 
 
 		 819 aa  355  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  30.82 
 
 		 808 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.37 
 
 		 850 aa  342  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 835 aa  325  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 835 aa  325  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 830 aa  318  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 830 aa  318  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 830 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 816 aa  317  7e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.62 
 
 		 857 aa  315  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  27.21 
 
 		 948 aa  280  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 799 aa  263  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 816 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 815 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  26.93 
 
 		 879 aa  257  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  28.16 
 
 		 822 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 843 aa  253  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 815 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 815 aa  251  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 816 aa  251  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 816 aa  250  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 826 aa  249  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 835 aa  246  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 812 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 837 aa  244  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 		 815 aa  240  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 817 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 819 aa  233  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  27.45 
 
 		 831 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  27.57 
 
 		 831 aa  229  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 		 831 aa  229  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 827 aa  227  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 823 aa  226  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 830 aa  220  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 821 aa  219  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  25.14 
 
 		 831 aa  218  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 806 aa  212  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  27.28 
 
 		 825 aa  211  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 806 aa  206  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  25.71 
 
 		 854 aa  203  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 806 aa  201  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 802 aa  198  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 831 aa  194  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  24.94 
 
 		 831 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 827 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  23.11 
 
 		 804 aa  171  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 805 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  24.97 
 
 		 801 aa  165  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 797 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 385 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  24.12 
 
 		 977 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31840  glycine cleavage system T protein  29.09 
 
 		 365 aa  113  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.15 
 
 		 365 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4806  glycine cleavage system T protein  24.82 
 
 		 383 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.87 
 
 		 381 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  26.93 
 
 		 1000 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 395 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  26.43 
 
 		 1000 aa  102  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  25.36 
 
 		 381 aa  102  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.6 
 
 		 363 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.44 
 
 		 363 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0056  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.24 
 
 		 384 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.44 
 
 		 363 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.89 
 
 		 1003 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  26.7 
 
 		 1003 aa  99  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3325  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.85 
 
 		 372 aa  98.6  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2576  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.92 
 
 		 364 aa  98.2  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213671  normal  0.0237764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  25.79 
 
 		 1003 aa  98.2  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.45 
 
 		 364 aa  97.8  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  26.29 
 
 		 440 aa  97.8  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  25.06 
 
 		 999 aa  97.8  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  25.73 
 
 		 965 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  26.29 
 
 		 442 aa  97.8  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2463  aminomethyltransferase  28.46 
 
 		 363 aa  97.4  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3003  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.17 
 
 		 372 aa  97.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  26.42 
 
 		 367 aa  97.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  28.41 
 
 		 937 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00861  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.49 
 
 		 359 aa  97.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  27.49 
 
 		 350 aa  97.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3880  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.52 
 
 		 372 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.14 
 
 		 963 aa  96.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  25.53 
 
 		 1003 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  25.53 
 
 		 1003 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0316  glycine cleavage system T protein  25.56 
 
 		 360 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.35 
 
 		 375 aa  95.9  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.43 
 
 		 364 aa  95.1  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  25.39 
 
 		 1003 aa  95.5  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.37 
 
 		 1003 aa  95.5  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.1 
 
 		 441 aa  95.5  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5428  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.4 
 
 		 360 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0297013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0143  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.46 
 
 		 372 aa  94.7  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228599  normal  0.397791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>