More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1864 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  82.53 
 
 		 853 aa  1511    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  81.95 
 
 		 853 aa  1507    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 853 aa  1765    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  82.53 
 
 		 853 aa  1513    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.3 
 
 		 838 aa  582  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  38.07 
 
 		 840 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 812 aa  361  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.93 
 
 		 821 aa  360  5e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.07 
 
 		 850 aa  360  6e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.37 
 
 		 830 aa  360  8e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  31.85 
 
 		 808 aa  358  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.51 
 
 		 819 aa  348  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.95 
 
 		 857 aa  346  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 835 aa  340  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 816 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 830 aa  333  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 835 aa  333  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 830 aa  330  8e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 830 aa  330  8e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  28.39 
 
 		 948 aa  293  7e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 815 aa  270  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  28.01 
 
 		 879 aa  268  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 799 aa  268  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 816 aa  268  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 816 aa  267  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  27.47 
 
 		 822 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 816 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 843 aa  256  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 815 aa  254  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 826 aa  254  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 815 aa  252  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 823 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 835 aa  250  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 819 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 817 aa  245  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 815 aa  243  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 837 aa  239  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 812 aa  238  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 825 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 827 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  26.45 
 
 		 831 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 831 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  26.82 
 
 		 831 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 830 aa  218  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 806 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 806 aa  214  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 821 aa  214  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  25.43 
 
 		 831 aa  213  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  24.71 
 
 		 831 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  26.57 
 
 		 854 aa  211  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 831 aa  208  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 827 aa  206  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  25.03 
 
 		 802 aa  202  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 806 aa  197  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 805 aa  185  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 801 aa  184  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 804 aa  176  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 		 797 aa  151  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 385 aa  118  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  24.87 
 
 		 371 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4806  glycine cleavage system T protein  26.47 
 
 		 383 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  26.33 
 
 		 977 aa  111  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.56 
 
 		 381 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31840  glycine cleavage system T protein  28.98 
 
 		 365 aa  106  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0799  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.06 
 
 		 390 aa  106  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.06 
 
 		 364 aa  105  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  25.72 
 
 		 381 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.11 
 
 		 363 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  23.75 
 
 		 961 aa  105  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.11 
 
 		 363 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  27.32 
 
 		 1000 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.36 
 
 		 365 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.75 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.15 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  28.09 
 
 		 364 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  24.53 
 
 		 370 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  28.03 
 
 		 440 aa  103  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  28.03 
 
 		 442 aa  103  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  27.6 
 
 		 1000 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.43 
 
 		 1003 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.66 
 
 		 1003 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.43 
 
 		 1003 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  23.26 
 
 		 371 aa  102  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.43 
 
 		 1003 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.43 
 
 		 1003 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.33 
 
 		 364 aa  101  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01760  conserved hypothetical protein  28.61 
 
 		 393 aa  100  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  26.24 
 
 		 350 aa  100  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0056  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.5 
 
 		 384 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.77 
 
 		 999 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.94 
 
 		 363 aa  100  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  27.49 
 
 		 1003 aa  99.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0806  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.34 
 
 		 390 aa  100  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000414833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.01 
 
 		 1003 aa  99.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.97 
 
 		 1003 aa  99.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  25.69 
 
 		 1003 aa  98.6  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68870  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.73 
 
 		 360 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  24.81 
 
 		 889 aa  98.2  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  28 
 
 		 1028 aa  98.2  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5428  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.76 
 
 		 360 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0297013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>