More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3463 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  57.69 
 
 		 948 aa  970    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  55.64 
 
 		 830 aa  912    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  68.55 
 
 		 821 aa  1168    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  54.22 
 
 		 816 aa  885    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  54.17 
 
 		 808 aa  852    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  65.78 
 
 		 819 aa  1141    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 830 aa  1707    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  56.12 
 
 		 830 aa  916    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  65.67 
 
 		 835 aa  1163    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  55.64 
 
 		 830 aa  912    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  52.16 
 
 		 812 aa  849    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  66.51 
 
 		 835 aa  1178    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.43 
 
 		 850 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.05 
 
 		 857 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37 
 
 		 838 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  37.11 
 
 		 840 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  34.92 
 
 		 822 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 815 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 816 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 816 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 843 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 815 aa  402  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 		 812 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 817 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 799 aa  382  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 815 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 853 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 853 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  30.83 
 
 		 831 aa  363  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 853 aa  363  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 825 aa  361  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 853 aa  360  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 831 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 827 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 823 aa  353  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 826 aa  343  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 816 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 815 aa  324  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 819 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 806 aa  320  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 806 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 827 aa  317  8e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  27.88 
 
 		 879 aa  313  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 805 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 837 aa  307  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 806 aa  301  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 831 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  28.79 
 
 		 831 aa  300  7e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  28.28 
 
 		 831 aa  295  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 835 aa  292  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  27 
 
 		 854 aa  284  5.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 821 aa  282  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  28.28 
 
 		 831 aa  280  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 802 aa  279  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 804 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 830 aa  270  8.999999999999999e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 797 aa  250  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 801 aa  231  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 		 772 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.95 
 
 		 761 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.47 
 
 		 362 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  30.43 
 
 		 977 aa  169  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  29.19 
 
 		 357 aa  161  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  30.35 
 
 		 965 aa  160  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.86 
 
 		 988 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  30.27 
 
 		 370 aa  159  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  29.85 
 
 		 968 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.89 
 
 		 366 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.89 
 
 		 366 aa  157  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.89 
 
 		 366 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.89 
 
 		 366 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.89 
 
 		 366 aa  157  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.08 
 
 		 364 aa  157  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07324  N,N-dimethylglycine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_2G16610)  30.27 
 
 		 393 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.64 
 
 		 366 aa  155  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.69 
 
 		 370 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.7 
 
 		 360 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  30.4 
 
 		 442 aa  154  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.64 
 
 		 366 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.64 
 
 		 366 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  30.4 
 
 		 440 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.98 
 
 		 375 aa  154  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  31.66 
 
 		 372 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01760  conserved hypothetical protein  31.99 
 
 		 393 aa  153  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  30.1 
 
 		 381 aa  153  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  30.17 
 
 		 961 aa  153  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.19 
 
 		 360 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.93 
 
 		 360 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  29.6 
 
 		 968 aa  153  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.93 
 
 		 364 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.81 
 
 		 360 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.45 
 
 		 371 aa  152  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.19 
 
 		 997 aa  152  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.85 
 
 		 967 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.46 
 
 		 366 aa  150  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.89 
 
 		 366 aa  150  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  30.65 
 
 		 360 aa  150  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.25 
 
 		 364 aa  148  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  30.15 
 
 		 389 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.46 
 
 		 364 aa  149  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>