More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3155 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  94.46 
 
 
831 aa  1608    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  78.34 
 
 
837 aa  1345    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  100 
 
 
831 aa  1719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  74.37 
 
 
835 aa  1294    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  79.42 
 
 
831 aa  1345    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  94.46 
 
 
831 aa  1610    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  46.05 
 
 
879 aa  723    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  81.89 
 
 
830 aa  1377    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  38.63 
 
 
816 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 
815 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
816 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
816 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
821 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 
806 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 
805 aa  458  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 
806 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
823 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  34.79 
 
 
831 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
831 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 
802 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 
806 aa  438  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
826 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 
827 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
804 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
815 aa  418  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
815 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  33.45 
 
 
843 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 
825 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  32.63 
 
 
822 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 
817 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
812 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 
815 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
819 aa  364  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
801 aa  358  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
827 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
799 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
812 aa  347  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 
797 aa  337  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  29.07 
 
 
819 aa  320  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.2 
 
 
850 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.47 
 
 
830 aa  308  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  28.59 
 
 
854 aa  307  6e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
835 aa  307  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  30.01 
 
 
816 aa  303  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.49 
 
 
821 aa  300  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
835 aa  293  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.45 
 
 
838 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  29.3 
 
 
808 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
830 aa  284  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
830 aa  284  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
830 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.91 
 
 
857 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  29.07 
 
 
840 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
853 aa  252  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  26.64 
 
 
948 aa  245  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 
853 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
853 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
853 aa  234  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  27.91 
 
 
925 aa  148  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  26.94 
 
 
1000 aa  145  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.22 
 
 
988 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  26.7 
 
 
1000 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  29.74 
 
 
961 aa  140  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  27.91 
 
 
977 aa  140  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.25 
 
 
974 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  31.48 
 
 
371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.51 
 
 
999 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  25.55 
 
 
1002 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.45 
 
 
995 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  25.3 
 
 
889 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  25.3 
 
 
1002 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  25.3 
 
 
1002 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  25.3 
 
 
1002 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.26 
 
 
441 aa  134  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  28.08 
 
 
365 aa  134  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  29.61 
 
 
999 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.01 
 
 
963 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  25.25 
 
 
365 aa  131  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  28.43 
 
 
965 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  29.41 
 
 
351 aa  130  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.95 
 
 
984 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  27.85 
 
 
995 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.29 
 
 
1003 aa  129  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  25.26 
 
 
1003 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  24.74 
 
 
1028 aa  128  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  24.55 
 
 
1003 aa  128  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  30.33 
 
 
370 aa  128  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.55 
 
 
1003 aa  128  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.55 
 
 
1003 aa  128  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.4 
 
 
364 aa  128  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.55 
 
 
1003 aa  128  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  27.82 
 
 
987 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
385 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.29 
 
 
1003 aa  127  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  26.32 
 
 
357 aa  127  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.82 
 
 
987 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.02 
 
 
767 aa  127  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.67 
 
 
365 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  28.26 
 
 
985 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.82 
 
 
362 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>