More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1666 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  47.96 
 
 		 817 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  49.04 
 
 		 815 aa  775    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  86.3 
 
 		 827 aa  1447    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  95.42 
 
 		 831 aa  1626    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  53.74 
 
 		 843 aa  848    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  68.47 
 
 		 825 aa  1135    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  49.28 
 
 		 812 aa  752    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  100 
 
 		 831 aa  1707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 819 aa  681    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  51.8 
 
 		 816 aa  860    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  51.56 
 
 		 816 aa  854    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  51.45 
 
 		 815 aa  808    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  44.43 
 
 		 815 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  60.17 
 
 		 826 aa  922    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  62.67 
 
 		 823 aa  1040    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 		 827 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  39.21 
 
 		 799 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  38.6 
 
 		 854 aa  553  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  39.34 
 
 		 822 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 806 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  33.96 
 
 		 879 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 806 aa  489  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 806 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 831 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  35.46 
 
 		 831 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 837 aa  455  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 802 aa  456  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 835 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  34.79 
 
 		 831 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 830 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 816 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  34.46 
 
 		 831 aa  428  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 805 aa  425  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 812 aa  426  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 804 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 815 aa  422  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  32.59 
 
 		 819 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 821 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.51 
 
 		 821 aa  389  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 835 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 830 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 830 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.09 
 
 		 850 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.83 
 
 		 830 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 835 aa  382  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.17 
 
 		 857 aa  376  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 797 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 816 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 830 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  31.25 
 
 		 808 aa  362  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 801 aa  331  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.07 
 
 		 838 aa  323  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  29.93 
 
 		 948 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  29.72 
 
 		 840 aa  274  5.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 853 aa  230  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 853 aa  219  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 853 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 853 aa  210  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 385 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 385 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  32.01 
 
 		 357 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 390 aa  166  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 385 aa  163  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.38 
 
 		 386 aa  162  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  37.42 
 
 		 372 aa  160  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 382 aa  158  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.27 
 
 		 368 aa  157  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 		 364 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.49 
 
 		 441 aa  155  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  31.82 
 
 		 371 aa  153  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  31.02 
 
 		 364 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 383 aa  152  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  34.82 
 
 		 381 aa  151  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  35.57 
 
 		 364 aa  150  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.06 
 
 		 362 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  28.33 
 
 		 365 aa  148  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  33.77 
 
 		 366 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.61 
 
 		 364 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  30.17 
 
 		 365 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  34.44 
 
 		 362 aa  147  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.85 
 
 		 364 aa  146  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.89 
 
 		 372 aa  145  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  35.01 
 
 		 391 aa  144  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  32.01 
 
 		 360 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.48 
 
 		 376 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  31.35 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  31.35 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  33.66 
 
 		 363 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 395 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  31.66 
 
 		 375 aa  140  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 378 aa  140  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 500 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.39 
 
 		 364 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 500 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  31.68 
 
 		 364 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  29.18 
 
 		 360 aa  139  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  33.52 
 
 		 371 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.21 
 
 		 370 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.08 
 
 		 989 aa  138  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.7 
 
 		 363 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>