More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3855 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  48.98 
 
 		 948 aa  718    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  53.76 
 
 		 835 aa  854    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  100 
 
 		 808 aa  1622    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  60.12 
 
 		 821 aa  929    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  57.16 
 
 		 819 aa  911    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  55.39 
 
 		 816 aa  847    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  56.47 
 
 		 830 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.16 
 
 		 830 aa  870    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  56.47 
 
 		 830 aa  864    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  56.47 
 
 		 830 aa  865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  57.09 
 
 		 812 aa  894    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  54.12 
 
 		 835 aa  866    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.43 
 
 		 850 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.51 
 
 		 838 aa  545  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.28 
 
 		 857 aa  541  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  39.73 
 
 		 840 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  35.75 
 
 		 822 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 816 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 815 aa  429  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 816 aa  426  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 843 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 		 815 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 812 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 817 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 825 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 823 aa  386  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 819 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 826 aa  379  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 853 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 853 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 815 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 853 aa  366  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  31.48 
 
 		 831 aa  365  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 853 aa  364  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 831 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 799 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 827 aa  349  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 827 aa  328  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  28.55 
 
 		 879 aa  319  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 815 aa  313  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 816 aa  307  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 835 aa  303  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 805 aa  301  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  29.9 
 
 		 831 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 837 aa  297  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 806 aa  297  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 806 aa  295  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 831 aa  294  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  29.72 
 
 		 831 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 802 aa  290  7e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  29.59 
 
 		 831 aa  287  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 806 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 804 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 830 aa  276  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  26.35 
 
 		 854 aa  269  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 797 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 821 aa  246  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 801 aa  226  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 		 761 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.49 
 
 		 790 aa  168  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  33.76 
 
 		 370 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.76 
 
 		 997 aa  165  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.26 
 
 		 781 aa  164  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  32.19 
 
 		 1000 aa  163  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01760  conserved hypothetical protein  30.98 
 
 		 393 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.69 
 
 		 752 aa  160  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  29.41 
 
 		 977 aa  158  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  31.81 
 
 		 371 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.94 
 
 		 995 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  26.22 
 
 		 371 aa  154  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  33.43 
 
 		 372 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  33.01 
 
 		 757 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07324  N,N-dimethylglycine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_2G16610)  31.35 
 
 		 393 aa  151  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.22 
 
 		 997 aa  151  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.31 
 
 		 370 aa  151  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.22 
 
 		 1003 aa  150  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.88 
 
 		 998 aa  150  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.55 
 
 		 364 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  28.5 
 
 		 357 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.52 
 
 		 772 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  30.71 
 
 		 995 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  30.92 
 
 		 997 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.13 
 
 		 999 aa  146  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  30.61 
 
 		 361 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.03 
 
 		 360 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.03 
 
 		 360 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.61 
 
 		 360 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.52 
 
 		 376 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  31.3 
 
 		 442 aa  144  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.36 
 
 		 366 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.36 
 
 		 366 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.36 
 
 		 366 aa  144  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.13 
 
 		 366 aa  144  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.36 
 
 		 366 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.36 
 
 		 366 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.74 
 
 		 364 aa  144  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.03 
 
 		 360 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  31.3 
 
 		 440 aa  144  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.71 
 
 		 999 aa  144  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.38 
 
 		 441 aa  143  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>