More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3460 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 781 aa  1597    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.87 
 
 		 761 aa  779    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.82 
 
 		 772 aa  811    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  70.05 
 
 		 790 aa  1127    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.83 
 
 		 789 aa  889    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  57.14 
 
 		 789 aa  885    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  57.61 
 
 		 757 aa  829    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  57.01 
 
 		 789 aa  896    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  57.14 
 
 		 752 aa  830    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.03 
 
 		 366 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.18 
 
 		 366 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.9 
 
 		 366 aa  207  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.9 
 
 		 366 aa  207  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.9 
 
 		 366 aa  207  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.34 
 
 		 366 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.34 
 
 		 366 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.34 
 
 		 366 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.34 
 
 		 366 aa  206  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.34 
 
 		 366 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.08 
 
 		 364 aa  206  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.31 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.34 
 
 		 366 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.63 
 
 		 368 aa  194  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  34.55 
 
 		 371 aa  193  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  35.96 
 
 		 365 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  34.37 
 
 		 366 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  33.04 
 
 		 357 aa  191  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  38.65 
 
 		 372 aa  191  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.15 
 
 		 441 aa  189  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.69 
 
 		 365 aa  188  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.39 
 
 		 370 aa  187  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.43 
 
 		 430 aa  187  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.71 
 
 		 364 aa  187  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.59 
 
 		 364 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  34.59 
 
 		 371 aa  184  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  34.84 
 
 		 363 aa  183  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35 
 
 		 360 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  32.55 
 
 		 365 aa  183  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.26 
 
 		 376 aa  183  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.04 
 
 		 364 aa  181  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  31.36 
 
 		 389 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  34.78 
 
 		 361 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5644  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.72 
 
 		 377 aa  178  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.457364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.52 
 
 		 365 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.14 
 
 		 363 aa  178  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.09 
 
 		 360 aa  178  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.14 
 
 		 363 aa  178  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6580  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.45 
 
 		 377 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852509  normal  0.0314164 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.78 
 
 		 363 aa  176  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  34.01 
 
 		 370 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3456  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.54 
 
 		 376 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  35.96 
 
 		 379 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  34.07 
 
 		 381 aa  173  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3311  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.58 
 
 		 377 aa  173  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.12 
 
 		 360 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5971  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.3 
 
 		 376 aa  172  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.37 
 
 		 366 aa  172  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  35.71 
 
 		 364 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  32.75 
 
 		 366 aa  171  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.82 
 
 		 360 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  31.86 
 
 		 364 aa  171  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  33.9 
 
 		 369 aa  170  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  37.76 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  34.67 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.87 
 
 		 362 aa  169  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  31.83 
 
 		 442 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  35.19 
 
 		 367 aa  168  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  31.83 
 
 		 440 aa  168  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.92 
 
 		 363 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  31.09 
 
 		 357 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.55 
 
 		 365 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.32 
 
 		 362 aa  165  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.88 
 
 		 382 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  31.34 
 
 		 360 aa  165  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  34.26 
 
 		 808 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  35.76 
 
 		 372 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.36 
 
 		 377 aa  163  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  32.66 
 
 		 375 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.23 
 
 		 372 aa  162  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  32.4 
 
 		 365 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  32.47 
 
 		 369 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.06 
 
 		 362 aa  161  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.83 
 
 		 380 aa  161  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.52 
 
 		 385 aa  160  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.58 
 
 		 365 aa  160  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  32.43 
 
 		 374 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  31.67 
 
 		 366 aa  158  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.18 
 
 		 363 aa  157  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1818  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 		 403 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  33.15 
 
 		 386 aa  156  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.82 
 
 		 359 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.96 
 
 		 360 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0537  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.44 
 
 		 382 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.33 
 
 		 369 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.33 
 
 		 369 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  29.66 
 
 		 360 aa  154  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.87 
 
 		 375 aa  154  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  32.38 
 
 		 360 aa  153  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.04 
 
 		 403 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.36 
 
 		 381 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>