More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1818 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1818  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 
403 aa  830    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  65.99 
 
 
425 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  64.04 
 
 
401 aa  518  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  51.07 
 
 
380 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113377  normal  0.236681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1444  putative dimethyl sulfoniopropionate demethylase  36.53 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8924  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2379  putative dimethyl sulfoniopropionate demethylase  36.8 
 
 
367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.649879  normal  0.648384 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2320  putative dimethyl sulfoniopropionate demethylase  35.77 
 
 
368 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.18 
 
 
772 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.44 
 
 
368 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  30.75 
 
 
370 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.73 
 
 
789 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.73 
 
 
789 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.03 
 
 
366 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32 
 
 
789 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.75 
 
 
366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.75 
 
 
366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.35 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.46 
 
 
366 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.86 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.46 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.46 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.46 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.46 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  31.55 
 
 
757 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.24 
 
 
364 aa  163  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  29.14 
 
 
371 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  29.52 
 
 
371 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.46 
 
 
366 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.59 
 
 
752 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 
781 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.79 
 
 
761 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.24 
 
 
364 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.19 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5961  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.16 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0205836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  29.65 
 
 
357 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.11 
 
 
364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  25.66 
 
 
365 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.02 
 
 
360 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.74 
 
 
380 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3605  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.47 
 
 
378 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  31.43 
 
 
367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.92 
 
 
441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.36 
 
 
790 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  31.93 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.18 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  28.27 
 
 
361 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.98 
 
 
376 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.25 
 
 
360 aa  146  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  27.18 
 
 
364 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.14 
 
 
362 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  25.73 
 
 
365 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.5 
 
 
400 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  29.65 
 
 
363 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.16 
 
 
364 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.56 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  29.26 
 
 
369 aa  139  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  27.23 
 
 
375 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.65 
 
 
360 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  29.06 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  28.33 
 
 
381 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.84 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.75 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.97 
 
 
360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.97 
 
 
360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  29.05 
 
 
381 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.29 
 
 
365 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.68 
 
 
430 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.46 
 
 
376 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.68 
 
 
360 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  29.67 
 
 
374 aa  133  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  28.03 
 
 
366 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  29.53 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.95 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  27.59 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  30.03 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.53 
 
 
362 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.89 
 
 
379 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.68 
 
 
359 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.7 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.7 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.35 
 
 
366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.43 
 
 
369 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.21 
 
 
365 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  27.79 
 
 
364 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0439  aminomethyltransferase  31.16 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.525568 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  28.31 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.79 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  28.99 
 
 
364 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28 
 
 
365 aa  126  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  29.13 
 
 
961 aa  126  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  28.25 
 
 
379 aa  126  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.61 
 
 
363 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.68 
 
 
403 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  28.53 
 
 
360 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.57 
 
 
363 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.19 
 
 
372 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 
375 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  27.81 
 
 
365 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  26.36 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.53 
 
 
988 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>