More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0923 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 
379 aa  770    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3605  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  73.19 
 
 
378 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  63.59 
 
 
376 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5961  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.88 
 
 
370 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0205836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0439  aminomethyltransferase  51.62 
 
 
372 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.525568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3456  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.59 
 
 
376 aa  299  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.05 
 
 
376 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5971  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.78 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132187 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5644  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.7 
 
 
377 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.457364  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6580  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.16 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852509  normal  0.0314164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3311  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.27 
 
 
377 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.38 
 
 
761 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.5 
 
 
360 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.81 
 
 
364 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.68 
 
 
364 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.83 
 
 
441 aa  169  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  35.07 
 
 
370 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  31.46 
 
 
357 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.98 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.06 
 
 
364 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  33.61 
 
 
371 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  34.39 
 
 
381 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.62 
 
 
789 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.38 
 
 
789 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.17 
 
 
364 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.28 
 
 
789 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.01 
 
 
360 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.49 
 
 
372 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  31.89 
 
 
364 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.62 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  32.73 
 
 
757 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0799  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.15 
 
 
390 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172783  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.1 
 
 
366 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.01 
 
 
366 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.32 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.05 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  33.13 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.32 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.53 
 
 
772 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.14 
 
 
360 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.14 
 
 
360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  31.38 
 
 
363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  32.54 
 
 
366 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0806  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.89 
 
 
390 aa  152  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000414833  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.01 
 
 
366 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.01 
 
 
366 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.01 
 
 
366 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.01 
 
 
366 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.01 
 
 
366 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  33.15 
 
 
361 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  31.67 
 
 
372 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.39 
 
 
752 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.06 
 
 
375 aa  149  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  28.02 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.04 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.47 
 
 
380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.92 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.76 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  28.72 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.76 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.52 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  30.9 
 
 
977 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.75 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  29.34 
 
 
360 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  31.18 
 
 
366 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  29.69 
 
 
365 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.32 
 
 
366 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.78 
 
 
790 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  32.6 
 
 
364 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  30.4 
 
 
375 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.02 
 
 
381 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.41 
 
 
370 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.22 
 
 
374 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  34.85 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3969  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.93 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.431724  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.49 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.77 
 
 
372 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.87 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  33.87 
 
 
379 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.8 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.99 
 
 
400 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.59 
 
 
362 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.26 
 
 
362 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  28.45 
 
 
961 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  33.16 
 
 
401 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.97 
 
 
368 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  31.93 
 
 
367 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  29.55 
 
 
389 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.81 
 
 
781 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  31.44 
 
 
375 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  29.52 
 
 
378 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.88 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2721  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.25 
 
 
364 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0309145  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  32.35 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3303  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.25 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00589278  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0833  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.53 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00162887  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  35.51 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.82 
 
 
368 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104311  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3675  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.64 
 
 
364 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.53 
 
 
379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>