More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5971 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3456  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  81.12 
 
 		 376 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5971  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 376 aa  775    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  73.53 
 
 		 376 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5644  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  68.97 
 
 		 377 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.457364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3311  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  68.7 
 
 		 377 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6580  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  68.17 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852509  normal  0.0314164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.78 
 
 		 379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0439  aminomethyltransferase  43.48 
 
 		 372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.525568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.98 
 
 		 376 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3605  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.26 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5961  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.95 
 
 		 370 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0205836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.29 
 
 		 761 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.25 
 
 		 772 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.49 
 
 		 789 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.06 
 
 		 789 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.3 
 
 		 781 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 		 789 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.4 
 
 		 752 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.43 
 
 		 790 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  31.88 
 
 		 757 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  32.01 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  30.27 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  32.19 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.24 
 
 		 360 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  32.19 
 
 		 366 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.12 
 
 		 366 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.12 
 
 		 366 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.12 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.12 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.82 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  31.62 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  27.75 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  31.91 
 
 		 370 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.58 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.23 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  33.92 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.88 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.61 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  29.41 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.53 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.29 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.84 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.42 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  33.04 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  35.11 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  30.32 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.56 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.87 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  29.14 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.87 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  29.82 
 
 		 367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  29.01 
 
 		 367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  28 
 
 		 357 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.81 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  31.28 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.49 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  28.57 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.89 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.71 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.49 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.71 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.03 
 
 		 441 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.24 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  31.08 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  27.01 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0338  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.41 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368876  normal  0.123109 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.15 
 
 		 363 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02950  aminomethyltransferase  31 
 
 		 388 aa  129  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.69 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  30.38 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.79 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  30.08 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  29.15 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.7 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.93 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  30.3 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3071  glycine cleavage system T protein  32.12 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.97 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  27.79 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  29 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  28.33 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0350  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.56 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.536076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  26.56 
 
 		 360 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.26 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  29.4 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  28.88 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  31.58 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.47 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0799  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.81 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  28.88 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.46 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.26 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  31.13 
 
 		 372 aa  123  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  30.14 
 
 		 370 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>