More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5961 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5961  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 
370 aa  759    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0205836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0439  aminomethyltransferase  58.74 
 
 
372 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.525568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.88 
 
 
379 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3605  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  51.51 
 
 
378 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  53.85 
 
 
376 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.41 
 
 
376 aa  252  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5971  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.95 
 
 
376 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3456  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.8 
 
 
376 aa  245  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6580  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.93 
 
 
377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852509  normal  0.0314164 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5644  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.27 
 
 
377 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.457364  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3311  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.27 
 
 
377 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.9 
 
 
761 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.58 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.89 
 
 
364 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.14 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.81 
 
 
789 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.7 
 
 
789 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.44 
 
 
789 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 
366 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  33.43 
 
 
757 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.14 
 
 
366 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.09 
 
 
772 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  31.43 
 
 
363 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.8 
 
 
364 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.14 
 
 
366 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.14 
 
 
366 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.14 
 
 
366 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
366 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
366 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
366 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
366 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
366 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.84 
 
 
372 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  30.08 
 
 
371 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  32.53 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1818  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.16 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.8 
 
 
362 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.88 
 
 
365 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  32.11 
 
 
370 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  30.4 
 
 
375 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.61 
 
 
752 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.59 
 
 
790 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  31.75 
 
 
381 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
366 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  29.89 
 
 
365 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.06 
 
 
430 aa  149  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.99 
 
 
781 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.79 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.49 
 
 
380 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113377  normal  0.236681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  34.64 
 
 
369 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  30.39 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.77 
 
 
360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.25 
 
 
370 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.05 
 
 
360 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.32 
 
 
360 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  28.18 
 
 
357 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.32 
 
 
360 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.43 
 
 
380 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.25 
 
 
363 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  30.41 
 
 
364 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.45 
 
 
368 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0799  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.41 
 
 
390 aa  142  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172783  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.46 
 
 
372 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  32.15 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.1 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  32.16 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  28.61 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.84 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.25 
 
 
374 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.58 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.55 
 
 
375 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  29.95 
 
 
361 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.51 
 
 
369 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  29.35 
 
 
366 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.4 
 
 
365 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  31.06 
 
 
366 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.04 
 
 
369 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.04 
 
 
369 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3480  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.37 
 
 
375 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.18 
 
 
370 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0622  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
364 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  28.88 
 
 
364 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  28.22 
 
 
401 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  30.42 
 
 
362 aa  135  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3329  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.51 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0617  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3619  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.44 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3211  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00211141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  30.91 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3801  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.88 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.785369  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3501  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.65276  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2721  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.33 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0309145  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0779  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  31.08 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  26.42 
 
 
356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  28.9 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0395  glycine cleavage system T protein  32.26 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  29.97 
 
 
977 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3331  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 
364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>