More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2496 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  51.33 
 
 		 963 aa  967    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  44.44 
 
 		 968 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  44.59 
 
 		 968 aa  816    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  50 
 
 		 961 aa  929    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.71 
 
 		 988 aa  993    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  48.82 
 
 		 961 aa  914    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  46.93 
 
 		 965 aa  855    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  100 
 
 		 977 aa  2013    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.22 
 
 		 967 aa  840    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  35.2 
 
 		 1000 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  34.93 
 
 		 1006 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.83 
 
 		 1005 aa  572  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.93 
 
 		 1006 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  36.24 
 
 		 1003 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  34.67 
 
 		 1000 aa  568  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  34.77 
 
 		 1005 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.17 
 
 		 1000 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.84 
 
 		 1004 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  34.02 
 
 		 993 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.84 
 
 		 1004 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.33 
 
 		 999 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.94 
 
 		 1004 aa  552  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.27 
 
 		 1002 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  35.36 
 
 		 1005 aa  552  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  35.69 
 
 		 1005 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.32 
 
 		 993 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.96 
 
 		 993 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.31 
 
 		 1005 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.33 
 
 		 1007 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.33 
 
 		 1007 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.84 
 
 		 1002 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.1 
 
 		 1010 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.84 
 
 		 1002 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.9 
 
 		 1003 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  34.84 
 
 		 1002 aa  539  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  35.2 
 
 		 1003 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.93 
 
 		 1003 aa  539  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.1 
 
 		 1003 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  35.29 
 
 		 1003 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.97 
 
 		 1003 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.42 
 
 		 1019 aa  534  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.97 
 
 		 1003 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.97 
 
 		 1003 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  35.03 
 
 		 1028 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.57 
 
 		 999 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.47 
 
 		 999 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.87 
 
 		 995 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.93 
 
 		 977 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  36.53 
 
 		 995 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.15 
 
 		 1003 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.93 
 
 		 997 aa  515  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.46 
 
 		 984 aa  511  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.77 
 
 		 995 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.85 
 
 		 1011 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.88 
 
 		 995 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.33 
 
 		 1005 aa  503  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.67 
 
 		 997 aa  499  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.03 
 
 		 997 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.35 
 
 		 995 aa  498  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.5 
 
 		 987 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.88 
 
 		 999 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.08 
 
 		 998 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.09 
 
 		 974 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.46 
 
 		 1009 aa  492  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  33.2 
 
 		 997 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  33.23 
 
 		 985 aa  485  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  32.38 
 
 		 987 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.32 
 
 		 1009 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.04 
 
 		 1008 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.49 
 
 		 1009 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  34.26 
 
 		 889 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.96 
 
 		 997 aa  465  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  32.8 
 
 		 984 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.99 
 
 		 992 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.4 
 
 		 976 aa  459  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.9 
 
 		 976 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.79 
 
 		 984 aa  452  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.14 
 
 		 981 aa  439  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.49 
 
 		 989 aa  432  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.71 
 
 		 987 aa  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  31.17 
 
 		 984 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  31.58 
 
 		 980 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  32.2 
 
 		 955 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.49 
 
 		 984 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.6 
 
 		 925 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  32.73 
 
 		 937 aa  363  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  31.69 
 
 		 980 aa  355  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.81 
 
 		 767 aa  326  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  35.83 
 
 		 909 aa  273  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  33.42 
 
 		 370 aa  197  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  32.28 
 
 		 357 aa  193  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  32.9 
 
 		 371 aa  192  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.6 
 
 		 857 aa  191  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  31.68 
 
 		 371 aa  190  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.89 
 
 		 360 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.71 
 
 		 360 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  33.25 
 
 		 365 aa  187  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.73 
 
 		 368 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.71 
 
 		 360 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.11 
 
 		 364 aa  185  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>