More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7231 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.9 
 
 
999 aa  825    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.99 
 
 
1005 aa  764    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45 
 
 
1004 aa  760    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  54.5 
 
 
1009 aa  1001    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  51.43 
 
 
980 aa  934    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.36 
 
 
999 aa  804    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  44.91 
 
 
997 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  46.52 
 
 
1003 aa  793    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  46.38 
 
 
1028 aa  802    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.12 
 
 
1003 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.71 
 
 
993 aa  783    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  43.97 
 
 
1007 aa  790    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  43.97 
 
 
1007 aa  790    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  45.72 
 
 
999 aa  828    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  44.8 
 
 
1006 aa  753    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.9 
 
 
1004 aa  760    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  92.99 
 
 
984 aa  1761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  45.61 
 
 
889 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  45 
 
 
1006 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  54.81 
 
 
989 aa  978    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.02 
 
 
997 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.51 
 
 
997 aa  753    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  46.26 
 
 
1003 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  55.01 
 
 
1008 aa  1006    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  47.43 
 
 
1002 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  47.52 
 
 
1002 aa  794    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  44.19 
 
 
1005 aa  747    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  45.71 
 
 
993 aa  785    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  47.72 
 
 
1003 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.77 
 
 
1005 aa  714    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  47.03 
 
 
1002 aa  809    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  46.22 
 
 
1000 aa  859    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  56.81 
 
 
987 aa  1037    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.65 
 
 
1009 aa  760    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  54.5 
 
 
1009 aa  1007    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.06 
 
 
995 aa  825    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  49.95 
 
 
976 aa  922    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.25 
 
 
998 aa  756    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  47.01 
 
 
1000 aa  821    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.24 
 
 
995 aa  798    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.9 
 
 
1004 aa  760    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.89 
 
 
1019 aa  749    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.41 
 
 
995 aa  799    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  70.95 
 
 
987 aa  1429    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  54.6 
 
 
984 aa  1036    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  100 
 
 
985 aa  1998    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.17 
 
 
1003 aa  811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.15 
 
 
1011 aa  732    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.91 
 
 
1000 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  43.66 
 
 
997 aa  753    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  52.5 
 
 
981 aa  964    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.62 
 
 
1003 aa  804    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  46.54 
 
 
1005 aa  775    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  55.53 
 
 
992 aa  1019    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  70.62 
 
 
987 aa  1410    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.11 
 
 
993 aa  790    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.57 
 
 
997 aa  800    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  47.52 
 
 
1002 aa  794    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.06 
 
 
1003 aa  794    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.42 
 
 
1003 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  47.11 
 
 
999 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.37 
 
 
984 aa  919    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.82 
 
 
1003 aa  806    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  47.07 
 
 
1005 aa  775    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.29 
 
 
1010 aa  768    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.62 
 
 
1003 aa  804    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  47.7 
 
 
995 aa  823    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.09 
 
 
1005 aa  762    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  49.29 
 
 
984 aa  863    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.03 
 
 
977 aa  710    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  53.05 
 
 
976 aa  937    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  47.66 
 
 
995 aa  818    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.31 
 
 
974 aa  664    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.46 
 
 
984 aa  622  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  41.91 
 
 
980 aa  598  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  42.25 
 
 
937 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  39.66 
 
 
925 aa  559  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  41.87 
 
 
955 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.18 
 
 
968 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  34.51 
 
 
968 aa  512  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.56 
 
 
988 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.76 
 
 
963 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  35.33 
 
 
961 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  35.15 
 
 
965 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  33.54 
 
 
961 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.47 
 
 
967 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  33.53 
 
 
977 aa  482  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.15 
 
 
767 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  49.58 
 
 
909 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
812 aa  154  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
816 aa  151  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
825 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 
843 aa  148  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
830 aa  145  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
816 aa  144  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
823 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.11 
 
 
368 aa  142  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
815 aa  142  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 
827 aa  142  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.19 
 
 
857 aa  141  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>