More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3838 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  45.96 
 
 		 817 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 812 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  52.34 
 
 		 854 aa  814    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  47.82 
 
 		 843 aa  707    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  50.91 
 
 		 819 aa  821    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 825 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  45.17 
 
 		 815 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  47.23 
 
 		 815 aa  709    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 		 815 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 827 aa  1648    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 823 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  42.38 
 
 		 831 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 831 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  45.73 
 
 		 826 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 		 816 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  42.91 
 
 		 827 aa  598  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  41.11 
 
 		 816 aa  598  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 799 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 		 816 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 815 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  37.77 
 
 		 822 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 806 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 806 aa  428  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 806 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 805 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  32.51 
 
 		 879 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 812 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 802 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 837 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 821 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 835 aa  385  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 804 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 831 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  32.9 
 
 		 831 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  32.58 
 
 		 831 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  32.78 
 
 		 831 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  33.37 
 
 		 830 aa  357  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 797 aa  337  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.23 
 
 		 830 aa  336  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.61 
 
 		 819 aa  335  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 835 aa  335  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 835 aa  333  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  32.44 
 
 		 808 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.56 
 
 		 857 aa  328  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.87 
 
 		 821 aa  325  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.19 
 
 		 850 aa  322  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 830 aa  322  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 816 aa  321  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.07 
 
 		 838 aa  319  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 830 aa  314  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 830 aa  314  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 801 aa  290  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  31.75 
 
 		 840 aa  264  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 853 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 853 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 853 aa  253  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 853 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  27.86 
 
 		 948 aa  248  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 385 aa  189  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.41 
 
 		 360 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 385 aa  174  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.35 
 
 		 360 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 385 aa  172  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.77 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.52 
 
 		 360 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.98 
 
 		 963 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.33 
 
 		 364 aa  168  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 368 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 385 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  33.15 
 
 		 977 aa  165  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.86 
 
 		 372 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 382 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  35.84 
 
 		 381 aa  160  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.21 
 
 		 364 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.93 
 
 		 386 aa  158  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  33.51 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  33.51 
 
 		 442 aa  156  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  37.23 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.35 
 
 		 366 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.67 
 
 		 362 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  33.23 
 
 		 357 aa  155  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.78 
 
 		 365 aa  154  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.8 
 
 		 360 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  30.91 
 
 		 968 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 390 aa  149  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 394 aa  149  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.53 
 
 		 366 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  33.82 
 
 		 381 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 394 aa  148  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  33.82 
 
 		 401 aa  148  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  34.6 
 
 		 364 aa  147  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.92 
 
 		 987 aa  147  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.8 
 
 		 366 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.8 
 
 		 366 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  30.32 
 
 		 364 aa  147  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.8 
 
 		 366 aa  147  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  33.05 
 
 		 366 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.9 
 
 		 441 aa  146  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.68 
 
 		 968 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.42 
 
 		 984 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>