More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2591 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  46.32 
 
 		 817 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  47.51 
 
 		 815 aa  695    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  51.54 
 
 		 843 aa  738    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  58.97 
 
 		 827 aa  881    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  43.69 
 
 		 812 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  47.36 
 
 		 816 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  60.15 
 
 		 831 aa  928    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  46.75 
 
 		 816 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  59.66 
 
 		 831 aa  920    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  57.95 
 
 		 825 aa  905    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  47.07 
 
 		 815 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 826 aa  1634    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  65.23 
 
 		 823 aa  1031    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  42.44 
 
 		 819 aa  625  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  46.2 
 
 		 827 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 		 815 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  41.34 
 
 		 799 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  42.26 
 
 		 822 aa  528  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  38.83 
 
 		 854 aa  499  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 816 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 837 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  34.67 
 
 		 831 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 		 806 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 831 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  32.21 
 
 		 879 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 806 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  35.26 
 
 		 831 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 806 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 835 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  35.11 
 
 		 831 aa  402  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 821 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 805 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 815 aa  396  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 802 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  34.67 
 
 		 808 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 804 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 		 812 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 830 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  33.86 
 
 		 819 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.18 
 
 		 830 aa  359  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 816 aa  357  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.16 
 
 		 821 aa  353  7e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 797 aa  347  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 830 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 830 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.9 
 
 		 838 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 830 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 801 aa  333  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 835 aa  323  6e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 835 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.75 
 
 		 857 aa  321  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.05 
 
 		 850 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  33.8 
 
 		 840 aa  305  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  28.93 
 
 		 948 aa  278  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 853 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 853 aa  271  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 853 aa  269  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 853 aa  268  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 390 aa  171  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 385 aa  160  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.38 
 
 		 386 aa  159  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 385 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 382 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 383 aa  151  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.8 
 
 		 363 aa  146  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.8 
 
 		 363 aa  146  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 392 aa  146  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 496 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 500 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 500 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 385 aa  144  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.07 
 
 		 364 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.46 
 
 		 366 aa  140  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 492 aa  137  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.06 
 
 		 366 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.06 
 
 		 366 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.06 
 
 		 366 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.06 
 
 		 366 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.06 
 
 		 366 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.37 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.06 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.37 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 381 aa  135  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.05 
 
 		 364 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 388 aa  134  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.97 
 
 		 366 aa  134  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.12 
 
 		 364 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  33.53 
 
 		 366 aa  132  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  28.5 
 
 		 1002 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.2 
 
 		 364 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  31.31 
 
 		 359 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  28.5 
 
 		 889 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  28.5 
 
 		 1002 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.75 
 
 		 366 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.5 
 
 		 1002 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  28.5 
 
 		 1002 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 385 aa  128  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>