More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1952 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  55.54 
 
 		 1004 aa  1073    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  46.03 
 
 		 937 aa  716    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  48.72 
 
 		 997 aa  896    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  87.44 
 
 		 1003 aa  1796    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  86.04 
 
 		 1003 aa  1763    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  82.88 
 
 		 1028 aa  1745    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.84 
 
 		 1003 aa  1791    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.45 
 
 		 974 aa  804    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  56.27 
 
 		 1007 aa  1112    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  56.27 
 
 		 1007 aa  1112    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  50.35 
 
 		 999 aa  955    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  45.33 
 
 		 987 aa  801    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  56 
 
 		 1006 aa  1085    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.98 
 
 		 995 aa  957    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.19 
 
 		 1008 aa  792    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  99.89 
 
 		 889 aa  1819    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  56.48 
 
 		 1006 aa  1091    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.45 
 
 		 989 aa  742    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  42.66 
 
 		 980 aa  686    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  48.46 
 
 		 997 aa  887    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.78 
 
 		 998 aa  901    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  83.65 
 
 		 1003 aa  1728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  51.88 
 
 		 995 aa  955    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.69 
 
 		 1009 aa  789    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  99.8 
 
 		 1002 aa  2048    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  56.65 
 
 		 1005 aa  1099    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  47.08 
 
 		 993 aa  864    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  42.51 
 
 		 984 aa  701    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  86.54 
 
 		 1003 aa  1781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  100 
 
 		 1002 aa  2053    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  51.54 
 
 		 999 aa  902    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  50.35 
 
 		 1000 aa  969    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.18 
 
 		 980 aa  764    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  97.9 
 
 		 1002 aa  2002    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.26 
 
 		 987 aa  745    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.58 
 
 		 767 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.36 
 
 		 1009 aa  857    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.18 
 
 		 993 aa  864    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  48.13 
 
 		 955 aa  799    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  44.73 
 
 		 992 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.18 
 
 		 976 aa  687    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  55.84 
 
 		 1005 aa  1082    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  80.96 
 
 		 1000 aa  1696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  55.64 
 
 		 1004 aa  1072    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  54.4 
 
 		 1019 aa  1023    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.86 
 
 		 984 aa  832    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  57.47 
 
 		 1005 aa  1085    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  54.11 
 
 		 1010 aa  1053    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.47 
 
 		 1011 aa  823    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.93 
 
 		 981 aa  735    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.94 
 
 		 1003 aa  1793    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  52.18 
 
 		 995 aa  958    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  83.93 
 
 		 999 aa  1734    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  99.9 
 
 		 1002 aa  2050    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  53.78 
 
 		 1005 aa  1008    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  50.2 
 
 		 997 aa  903    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  51.68 
 
 		 995 aa  952    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  47.43 
 
 		 985 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  50.6 
 
 		 999 aa  941    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  80.06 
 
 		 1000 aa  1648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.44 
 
 		 1003 aa  1777    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  85.94 
 
 		 1003 aa  1778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  57.47 
 
 		 1005 aa  1086    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.16 
 
 		 984 aa  798    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.08 
 
 		 993 aa  865    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.94 
 
 		 1003 aa  1793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.28 
 
 		 987 aa  818    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  52.71 
 
 		 995 aa  970    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.59 
 
 		 977 aa  825    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  46.54 
 
 		 925 aa  755    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.53 
 
 		 976 aa  720    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.61 
 
 		 984 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.69 
 
 		 1009 aa  799    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  57.41 
 
 		 1005 aa  1102    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.13 
 
 		 984 aa  711    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  55.54 
 
 		 1004 aa  1073    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.72 
 
 		 997 aa  871    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  47.77 
 
 		 997 aa  876    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  53 
 
 		 1003 aa  974    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  37.23 
 
 		 968 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  37.29 
 
 		 968 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  36.71 
 
 		 965 aa  592  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.49 
 
 		 967 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.01 
 
 		 963 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  36.14 
 
 		 961 aa  561  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  34.94 
 
 		 977 aa  544  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.25 
 
 		 988 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  35.09 
 
 		 961 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  52.85 
 
 		 909 aa  478  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.17 
 
 		 364 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.39 
 
 		 364 aa  178  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 799 aa  172  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.38 
 
 		 380 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  32.74 
 
 		 366 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  30.68 
 
 		 440 aa  162  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  29.17 
 
 		 442 aa  162  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.05 
 
 		 857 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.61 
 
 		 441 aa  159  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.86 
 
 		 371 aa  157  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.56 
 
 		 368 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>