More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0274 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
381 aa  785    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  54.19 
 
 
382 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  52.62 
 
 
382 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  48.37 
 
 
383 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  44.18 
 
 
390 aa  344  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  45.05 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  40.78 
 
 
385 aa  292  6e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 
395 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 
496 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 
385 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 
500 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 
500 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 
492 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
385 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 
385 aa  238  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  35.45 
 
 
386 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 
378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
376 aa  207  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 
413 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
413 aa  192  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  30.99 
 
 
413 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
413 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
413 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
413 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
816 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
394 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.58 
 
 
423 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
816 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
413 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
394 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  32.99 
 
 
417 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.32 
 
 
414 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
412 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  31.7 
 
 
416 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  31.7 
 
 
416 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  30.59 
 
 
417 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  33.51 
 
 
417 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
395 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.82 
 
 
414 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
823 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.25 
 
 
416 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  30.73 
 
 
417 aa  176  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.36 
 
 
417 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0046  sarcosine oxidase subunit beta  29.59 
 
 
414 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.570395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4830  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  29.86 
 
 
414 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.53 
 
 
416 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.32 
 
 
417 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  31.27 
 
 
417 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2752  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.81 
 
 
417 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3504  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.86 
 
 
414 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0869  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.08 
 
 
417 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.49 
 
 
431 aa  170  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5069  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.59 
 
 
414 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
393 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0486  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  29.59 
 
 
414 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3333  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.14 
 
 
414 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156184  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1600  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  29.59 
 
 
414 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.323345  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3216  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.59 
 
 
421 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0868127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5128  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.59 
 
 
414 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68928  normal  0.839713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5151  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.59 
 
 
421 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4546  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.59 
 
 
414 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0996  sarcosine oxidase, beta subunit, putative  29.86 
 
 
414 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0395  sarcosine oxidase, beta subunit  29.86 
 
 
414 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1862  glycine/D-amino acid oxidases  29.86 
 
 
414 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1954  sarcosine oxidase beta subunit  29.86 
 
 
414 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0460  sarcosine oxidase, beta subunit  29.84 
 
 
416 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
387 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  26.96 
 
 
415 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  30.99 
 
 
417 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.11 
 
 
417 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.96 
 
 
415 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1101  sarcosine oxidase subunit beta  29.86 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  31.49 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  31.49 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5207  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  29.57 
 
 
416 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0323  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.84 
 
 
416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.968117  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0345  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.84 
 
 
416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  31.49 
 
 
369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0346  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.84 
 
 
416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
799 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  31.49 
 
 
369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  31.22 
 
 
369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6204  sarcosine oxidase subunit beta  28.61 
 
 
416 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4713  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  29.3 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
806 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3774  sarcosine oxidase beta subunit  31 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71470  sarcosine oxidase beta subunit  28.34 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  30.94 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  31.22 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.76 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  31.22 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4884  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.16 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.64 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.72 
 
 
415 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>