More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1822 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 838 aa  1706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  60.91 
 
 		 840 aa  991    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  42.38 
 
 		 812 aa  605  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 		 853 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 		 853 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 		 853 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 		 853 aa  568  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.19 
 
 		 821 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  38.1 
 
 		 808 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  37.5 
 
 		 819 aa  531  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37 
 
 		 830 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 816 aa  521  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 830 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 830 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 830 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.01 
 
 		 850 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 		 835 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.98 
 
 		 857 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 835 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  33.6 
 
 		 822 aa  429  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  33.69 
 
 		 948 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 815 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 816 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 816 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 843 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 815 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 823 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 817 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 812 aa  357  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 825 aa  351  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 815 aa  348  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 819 aa  343  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 826 aa  337  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 816 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 799 aa  327  8.000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 802 aa  326  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  31.07 
 
 		 831 aa  323  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 806 aa  322  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 806 aa  322  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 827 aa  317  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 831 aa  317  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 831 aa  308  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  30.27 
 
 		 831 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 806 aa  305  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 815 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  27.28 
 
 		 879 aa  303  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 827 aa  299  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 805 aa  296  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 835 aa  293  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 837 aa  292  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  29.36 
 
 		 831 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  28.05 
 
 		 854 aa  285  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  28.64 
 
 		 831 aa  282  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 830 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 804 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 821 aa  263  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  27.28 
 
 		 801 aa  229  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 797 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  30.97 
 
 		 965 aa  156  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  28.42 
 
 		 357 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  27.74 
 
 		 364 aa  155  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.39 
 
 		 364 aa  153  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.91 
 
 		 368 aa  153  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  26.67 
 
 		 371 aa  152  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.17 
 
 		 761 aa  152  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  28.91 
 
 		 968 aa  150  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  28.61 
 
 		 365 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.18 
 
 		 364 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.5 
 
 		 369 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  30.7 
 
 		 370 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  28.27 
 
 		 968 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.27 
 
 		 967 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  29.31 
 
 		 366 aa  145  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.85 
 
 		 360 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  25.64 
 
 		 977 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  31.74 
 
 		 401 aa  142  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  29.66 
 
 		 389 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  29.85 
 
 		 371 aa  141  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.68 
 
 		 999 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  29.69 
 
 		 925 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.03 
 
 		 1003 aa  139  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  28.57 
 
 		 440 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  28.57 
 
 		 442 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.28 
 
 		 1003 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.92 
 
 		 1003 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.26 
 
 		 366 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.61 
 
 		 360 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.03 
 
 		 1003 aa  138  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.82 
 
 		 380 aa  138  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.03 
 
 		 1003 aa  138  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  31.45 
 
 		 379 aa  138  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.03 
 
 		 1003 aa  138  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.55 
 
 		 365 aa  138  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.32 
 
 		 441 aa  138  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  28.64 
 
 		 1000 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.52 
 
 		 366 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.52 
 
 		 366 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.68 
 
 		 364 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  28.64 
 
 		 375 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.57 
 
 		 1000 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>