More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1652 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  55.14 
 
 		 984 aa  1021    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  44.7 
 
 		 1004 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.86 
 
 		 995 aa  775    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.6 
 
 		 999 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.71 
 
 		 995 aa  786    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.21 
 
 		 999 aa  798    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  100 
 
 		 1009 aa  2027    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  45.83 
 
 		 1003 aa  788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  45.29 
 
 		 1028 aa  801    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  42.07 
 
 		 1007 aa  762    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  42.07 
 
 		 1007 aa  762    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  46.05 
 
 		 999 aa  818    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.18 
 
 		 1005 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  43.95 
 
 		 1006 aa  735    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.26 
 
 		 997 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.92 
 
 		 995 aa  784    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  45.08 
 
 		 889 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  46.59 
 
 		 1002 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  44.05 
 
 		 1006 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.81 
 
 		 974 aa  705    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.88 
 
 		 1003 aa  777    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42 
 
 		 1010 aa  734    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  46.05 
 
 		 1003 aa  797    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  46.49 
 
 		 1002 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  44.25 
 
 		 1005 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  44.23 
 
 		 993 aa  767    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.03 
 
 		 1003 aa  804    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  46.43 
 
 		 1003 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  96.73 
 
 		 1008 aa  1916    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.16 
 
 		 995 aa  781    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  52.72 
 
 		 987 aa  992    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.31 
 
 		 997 aa  776    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  46.79 
 
 		 1002 aa  818    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  43.74 
 
 		 997 aa  742    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  61.95 
 
 		 987 aa  1168    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  54.3 
 
 		 984 aa  971    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.82 
 
 		 1009 aa  778    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  45.6 
 
 		 1005 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  54.89 
 
 		 984 aa  1018    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  49.24 
 
 		 976 aa  910    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.63 
 
 		 1003 aa  806    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  45.27 
 
 		 1000 aa  808    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.72 
 
 		 1019 aa  724    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  61.76 
 
 		 992 aa  1171    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  44.96 
 
 		 1000 aa  769    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  58.03 
 
 		 984 aa  1150    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  94.25 
 
 		 1009 aa  1883    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.83 
 
 		 1011 aa  724    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  54.5 
 
 		 985 aa  1018    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.05 
 
 		 995 aa  764    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  49.65 
 
 		 981 aa  914    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.43 
 
 		 1003 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  45.71 
 
 		 1000 aa  842    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  47.45 
 
 		 999 aa  772    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.49 
 
 		 998 aa  724    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  52.12 
 
 		 980 aa  945    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.95 
 
 		 997 aa  786    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45 
 
 		 1005 aa  763    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.8 
 
 		 1004 aa  761    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.59 
 
 		 1005 aa  756    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  53.17 
 
 		 987 aa  1012    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.73 
 
 		 1003 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  45.88 
 
 		 1005 aa  747    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.53 
 
 		 1003 aa  803    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.43 
 
 		 1003 aa  803    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.08 
 
 		 997 aa  744    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.93 
 
 		 993 aa  774    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  46.49 
 
 		 1002 aa  795    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.61 
 
 		 977 aa  726    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  57.72 
 
 		 976 aa  1034    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  63 
 
 		 989 aa  1137    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.7 
 
 		 1004 aa  762    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.08 
 
 		 993 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  42.36 
 
 		 955 aa  620  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  41.67 
 
 		 925 aa  585  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  39.59 
 
 		 984 aa  568  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  40.2 
 
 		 980 aa  552  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  41.5 
 
 		 937 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.4 
 
 		 967 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.1 
 
 		 988 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.35 
 
 		 963 aa  486  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  34.32 
 
 		 977 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  33.73 
 
 		 965 aa  479  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.03 
 
 		 968 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  33.13 
 
 		 968 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  35.3 
 
 		 961 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  33.43 
 
 		 961 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.91 
 
 		 767 aa  452  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  50.21 
 
 		 909 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.75 
 
 		 857 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 815 aa  137  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.45 
 
 		 850 aa  135  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 812 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 815 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 816 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 816 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.61 
 
 		 364 aa  128  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.58 
 
 		 364 aa  127  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 815 aa  127  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 830 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>