More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0515 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  44.95 
 
 		 1004 aa  784    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.38 
 
 		 995 aa  842    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.7 
 
 		 984 aa  672    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  44.31 
 
 		 997 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.77 
 
 		 989 aa  681    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  46.67 
 
 		 1003 aa  829    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  46.42 
 
 		 1028 aa  841    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.08 
 
 		 997 aa  799    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  41.29 
 
 		 1007 aa  744    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  41.29 
 
 		 1007 aa  744    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  47.36 
 
 		 999 aa  846    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  45.52 
 
 		 1006 aa  788    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.78 
 
 		 1000 aa  840    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  45.53 
 
 		 889 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  41.77 
 
 		 984 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.29 
 
 		 1009 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  45.52 
 
 		 1006 aa  790    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  46.49 
 
 		 1003 aa  833    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.95 
 
 		 1004 aa  785    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.52 
 
 		 999 aa  840    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  46.22 
 
 		 1002 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.3 
 
 		 987 aa  728    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  45.8 
 
 		 1005 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  65.66 
 
 		 993 aa  1338    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  47.02 
 
 		 1003 aa  843    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  42.84 
 
 		 985 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  43.44 
 
 		 987 aa  732    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.04 
 
 		 1005 aa  787    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  44.1 
 
 		 992 aa  720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  44.34 
 
 		 1009 aa  728    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  46.45 
 
 		 1002 aa  831    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.23 
 
 		 987 aa  707    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  42.37 
 
 		 980 aa  678    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  63.22 
 
 		 1009 aa  1271    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.06 
 
 		 997 aa  778    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  44.91 
 
 		 997 aa  796    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.89 
 
 		 976 aa  681    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.56 
 
 		 1005 aa  791    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  65.45 
 
 		 993 aa  1337    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  46.52 
 
 		 1000 aa  856    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.67 
 
 		 1003 aa  842    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.63 
 
 		 1010 aa  796    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.09 
 
 		 1019 aa  763    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.27 
 
 		 998 aa  786    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.24 
 
 		 984 aa  765    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.24 
 
 		 1004 aa  786    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  61.97 
 
 		 1011 aa  1268    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.03 
 
 		 1008 aa  738    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.85 
 
 		 995 aa  834    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.98 
 
 		 981 aa  674    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.77 
 
 		 1003 aa  843    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  46.32 
 
 		 1002 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.03 
 
 		 995 aa  827    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  46.41 
 
 		 1000 aa  843    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  42.48 
 
 		 984 aa  658    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.61 
 
 		 997 aa  832    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  47.65 
 
 		 999 aa  813    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  44.76 
 
 		 1005 aa  758    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.72 
 
 		 1003 aa  841    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  44.86 
 
 		 1005 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  44.65 
 
 		 909 aa  760    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.77 
 
 		 1003 aa  843    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.97 
 
 		 1003 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.33 
 
 		 995 aa  831    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.9 
 
 		 995 aa  820    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  100 
 
 		 977 aa  2002    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  46.32 
 
 		 1002 aa  822    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44 
 
 		 976 aa  686    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.72 
 
 		 1003 aa  844    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.75 
 
 		 999 aa  838    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.06 
 
 		 1003 aa  827    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.49 
 
 		 1005 aa  711    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  66.16 
 
 		 993 aa  1340    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.03 
 
 		 974 aa  748    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.6 
 
 		 984 aa  625  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  40.45 
 
 		 980 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  41.99 
 
 		 937 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  41.2 
 
 		 925 aa  598  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  42.33 
 
 		 955 aa  581  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.76 
 
 		 767 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.24 
 
 		 968 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  36.34 
 
 		 968 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.97 
 
 		 963 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  35.8 
 
 		 965 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.4 
 
 		 967 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  33.93 
 
 		 977 aa  511  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.22 
 
 		 988 aa  475  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  31.85 
 
 		 961 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  34.09 
 
 		 961 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.37 
 
 		 364 aa  173  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.63 
 
 		 364 aa  172  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  30.39 
 
 		 371 aa  165  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  32.29 
 
 		 364 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  29.78 
 
 		 357 aa  162  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  30.75 
 
 		 369 aa  161  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.46 
 
 		 363 aa  161  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.18 
 
 		 364 aa  154  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.9 
 
 		 362 aa  154  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  31.33 
 
 		 370 aa  152  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  27.46 
 
 		 365 aa  152  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>