More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0454 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  39.77 
 
 
968 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  40.29 
 
 
968 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  49.17 
 
 
963 aa  873    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.56 
 
 
967 aa  754    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  43.76 
 
 
961 aa  809    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  100 
 
 
961 aa  1965    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  41.73 
 
 
965 aa  723    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  48.82 
 
 
977 aa  908    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.48 
 
 
988 aa  944    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  35.92 
 
 
1000 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  35.24 
 
 
1000 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.91 
 
 
1000 aa  529  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.16 
 
 
999 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  35.67 
 
 
1003 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.09 
 
 
1002 aa  515  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.23 
 
 
1003 aa  512  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.05 
 
 
998 aa  510  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  34.41 
 
 
1028 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.79 
 
 
1003 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.89 
 
 
1003 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.83 
 
 
1003 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.89 
 
 
1003 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.69 
 
 
1003 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.99 
 
 
1002 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.99 
 
 
1002 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  34.89 
 
 
1002 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  34.87 
 
 
1003 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  34.56 
 
 
1003 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.42 
 
 
984 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.6 
 
 
985 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.15 
 
 
1019 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.16 
 
 
999 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.06 
 
 
1007 aa  478  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.06 
 
 
1007 aa  478  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  34.19 
 
 
987 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.41 
 
 
995 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.61 
 
 
995 aa  479  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.61 
 
 
995 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.15 
 
 
997 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.74 
 
 
995 aa  475  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33 
 
 
993 aa  476  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  33 
 
 
993 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.2 
 
 
984 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.17 
 
 
1006 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  37.26 
 
 
995 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  34.17 
 
 
1006 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.06 
 
 
987 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.97 
 
 
999 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.27 
 
 
993 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.6 
 
 
997 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.11 
 
 
1010 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  33.75 
 
 
997 aa  469  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.67 
 
 
997 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  33.7 
 
 
1004 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.6 
 
 
1004 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.44 
 
 
974 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.01 
 
 
984 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.53 
 
 
1004 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.02 
 
 
976 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.09 
 
 
977 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.7 
 
 
1005 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.5 
 
 
1008 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  34.77 
 
 
992 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.21 
 
 
1005 aa  458  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  34.64 
 
 
1005 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.81 
 
 
1009 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.23 
 
 
1005 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.34 
 
 
999 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.44 
 
 
1011 aa  452  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  35.51 
 
 
1009 aa  452  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  34.47 
 
 
1005 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.53 
 
 
976 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  34.67 
 
 
1005 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.71 
 
 
1003 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.86 
 
 
1009 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.95 
 
 
981 aa  442  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.71 
 
 
997 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  34.15 
 
 
889 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.43 
 
 
987 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.87 
 
 
989 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  31.68 
 
 
984 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  35.65 
 
 
955 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  31.76 
 
 
980 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.97 
 
 
984 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  33.2 
 
 
980 aa  355  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.88 
 
 
925 aa  345  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.27 
 
 
767 aa  313  6.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  35.09 
 
 
937 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  35.73 
 
 
909 aa  241  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.33 
 
 
365 aa  170  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.49 
 
 
360 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.79 
 
 
360 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.79 
 
 
360 aa  164  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.18 
 
 
364 aa  163  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.04 
 
 
368 aa  162  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.52 
 
 
360 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  31.63 
 
 
381 aa  159  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  33.33 
 
 
369 aa  159  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  27.81 
 
 
365 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  29.7 
 
 
357 aa  154  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>