More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4828 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  54.5 
 
 
1010 aa  1063    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  48.02 
 
 
997 aa  882    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.29 
 
 
995 aa  945    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  55.11 
 
 
1004 aa  1061    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.49 
 
 
998 aa  900    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  42.43 
 
 
980 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  85.04 
 
 
1003 aa  1743    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.87 
 
 
993 aa  858    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  83.07 
 
 
1028 aa  1746    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  55.69 
 
 
1007 aa  1107    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  55.69 
 
 
1007 aa  1107    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  50.75 
 
 
999 aa  960    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  55.42 
 
 
1006 aa  1076    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  79.38 
 
 
1000 aa  1624    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.15 
 
 
980 aa  753    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  83.35 
 
 
889 aa  1509    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  55.82 
 
 
1006 aa  1080    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  51.39 
 
 
995 aa  946    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  58.02 
 
 
1005 aa  1100    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  83.65 
 
 
1002 aa  1707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.95 
 
 
985 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  100 
 
 
1003 aa  2062    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  47.37 
 
 
997 aa  872    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  56.65 
 
 
1005 aa  1082    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  83.65 
 
 
1002 aa  1709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  55.86 
 
 
1005 aa  1092    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  46.77 
 
 
993 aa  858    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.74 
 
 
1003 aa  1782    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  86.34 
 
 
1003 aa  1775    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  46.03 
 
 
925 aa  735    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  52 
 
 
999 aa  913    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  46.29 
 
 
1009 aa  776    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.06 
 
 
993 aa  863    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  55.11 
 
 
1004 aa  1060    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  84.35 
 
 
1002 aa  1745    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  52.48 
 
 
995 aa  957    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  45.07 
 
 
987 aa  737    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  50.89 
 
 
995 aa  937    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  47.39 
 
 
1009 aa  858    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  48.76 
 
 
997 aa  899    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  49.33 
 
 
955 aa  743    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.63 
 
 
976 aa  690    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  79.48 
 
 
1000 aa  1664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  83.75 
 
 
1002 aa  1710    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  53.17 
 
 
1003 aa  956    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  54.94 
 
 
1019 aa  1032    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  50.15 
 
 
1000 aa  957    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.01 
 
 
984 aa  717    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.53 
 
 
984 aa  840    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.9 
 
 
987 aa  802    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.16 
 
 
1011 aa  829    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  46.19 
 
 
937 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.54 
 
 
981 aa  732    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.64 
 
 
1003 aa  1780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.84 
 
 
1003 aa  1781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  82.45 
 
 
999 aa  1707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  50.45 
 
 
997 aa  899    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  55.11 
 
 
1004 aa  1062    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.31 
 
 
974 aa  799    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  52.29 
 
 
995 aa  960    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.23 
 
 
1009 aa  781    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.94 
 
 
1003 aa  1783    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.75 
 
 
984 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  44.84 
 
 
992 aa  740    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  57.82 
 
 
1005 aa  1100    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.02 
 
 
984 aa  790    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.64 
 
 
1003 aa  1780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  49.22 
 
 
767 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  52.88 
 
 
1005 aa  981    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  45.63 
 
 
987 aa  801    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.49 
 
 
977 aa  823    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.86 
 
 
976 aa  718    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  86.34 
 
 
1003 aa  1776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  55.3 
 
 
1005 aa  1074    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  50.65 
 
 
999 aa  946    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  46.31 
 
 
989 aa  721    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.81 
 
 
997 aa  884    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  41.93 
 
 
984 aa  698    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  45.84 
 
 
1008 aa  772    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  38.82 
 
 
968 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  38.42 
 
 
968 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  37.07 
 
 
965 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.28 
 
 
967 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  36.42 
 
 
961 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.94 
 
 
963 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  36.24 
 
 
977 aa  552  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.85 
 
 
988 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  35.67 
 
 
961 aa  509  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  54.3 
 
 
909 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.95 
 
 
364 aa  189  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.21 
 
 
364 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  31.98 
 
 
366 aa  160  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.29 
 
 
857 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
799 aa  159  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  30.79 
 
 
440 aa  157  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  29.27 
 
 
442 aa  157  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
843 aa  156  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.99 
 
 
441 aa  156  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  28.65 
 
 
371 aa  156  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
825 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>