More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3187 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 
376 aa  763    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3605  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  69.11 
 
 
378 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  63.59 
 
 
379 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5961  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  53.85 
 
 
370 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0205836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0439  aminomethyltransferase  53.93 
 
 
372 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.525568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3456  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.55 
 
 
376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5971  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.98 
 
 
376 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132187 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5644  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40 
 
 
377 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.457364  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6580  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.73 
 
 
377 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852509  normal  0.0314164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.36 
 
 
376 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3311  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.77 
 
 
377 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.59 
 
 
364 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.07 
 
 
441 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  34.23 
 
 
371 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.06 
 
 
789 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  34.07 
 
 
370 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  31.86 
 
 
365 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.98 
 
 
761 aa  170  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.49 
 
 
364 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.47 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.06 
 
 
366 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.02 
 
 
364 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.76 
 
 
366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.65 
 
 
789 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.76 
 
 
366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  29.33 
 
 
357 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  33.24 
 
 
361 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.94 
 
 
366 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.56 
 
 
789 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.45 
 
 
366 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.54 
 
 
366 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.45 
 
 
366 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.45 
 
 
366 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.45 
 
 
366 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.45 
 
 
366 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.77 
 
 
360 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  31.39 
 
 
366 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.89 
 
 
363 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.93 
 
 
360 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.73 
 
 
430 aa  157  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.49 
 
 
360 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.45 
 
 
366 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  31.06 
 
 
372 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.21 
 
 
360 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  29.68 
 
 
371 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.43 
 
 
365 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  29.66 
 
 
360 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  30.86 
 
 
364 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  31.91 
 
 
381 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  29.81 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  31.86 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.6 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.79 
 
 
380 aa  146  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1818  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.98 
 
 
403 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0799  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.06 
 
 
390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172783  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.78 
 
 
781 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.28 
 
 
772 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0806  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.06 
 
 
390 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000414833  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.87 
 
 
365 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.34 
 
 
375 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  30.3 
 
 
365 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.17 
 
 
362 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.97 
 
 
360 aa  143  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.09 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.22 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  28.05 
 
 
961 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  31.32 
 
 
757 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  32.84 
 
 
369 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3969  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.38 
 
 
364 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.431724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4806  glycine cleavage system T protein  33.42 
 
 
383 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.92 
 
 
365 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.2 
 
 
400 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3675  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.97 
 
 
364 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  31.32 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.23 
 
 
752 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  31.09 
 
 
379 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  31.13 
 
 
369 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  31.63 
 
 
425 aa  135  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.2 
 
 
790 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2721  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.61 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0309145  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  28.5 
 
 
389 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.22 
 
 
370 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  29.3 
 
 
375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.77 
 
 
362 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.62 
 
 
363 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.62 
 
 
363 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00861  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.12 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.48 
 
 
369 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  30 
 
 
351 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2463  aminomethyltransferase  30.73 
 
 
363 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27536  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.72 
 
 
372 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.74 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.56 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  30.19 
 
 
401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3592  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.95 
 
 
359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  28.34 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0779  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.41 
 
 
364 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3160  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.54 
 
 
375 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.94655  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.08 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3303  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.09 
 
 
364 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00589278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>