More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4387 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 370 aa  741    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  59.47 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  56.95 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  53.62 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  56.33 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  52.82 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  52.6 
 
 		 365 aa  375  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  53.08 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  53.24 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  53.62 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  52.82 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  52.15 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.8 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.28 
 
 		 374 aa  359  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  52.55 
 
 		 372 aa  359  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  53.51 
 
 		 373 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  53.89 
 
 		 373 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  53.24 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  53.78 
 
 		 376 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  52.7 
 
 		 373 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  51.47 
 
 		 409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  52.16 
 
 		 373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  51.21 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  51.89 
 
 		 376 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  51.89 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  49.47 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  50.81 
 
 		 384 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.53 
 
 		 382 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.32 
 
 		 387 aa  338  9e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  49.05 
 
 		 408 aa  337  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.8 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.73 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.14 
 
 		 379 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  49.47 
 
 		 376 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  51.73 
 
 		 376 aa  332  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  50.66 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  52.94 
 
 		 374 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  52.3 
 
 		 376 aa  328  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  49.86 
 
 		 366 aa  328  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  52.29 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.53 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  51.34 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.6 
 
 		 379 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.93 
 
 		 382 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  51.08 
 
 		 366 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  52.59 
 
 		 377 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  49.87 
 
 		 380 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.12 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  51.19 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.85 
 
 		 377 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.6 
 
 		 382 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.32 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.2 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.2 
 
 		 378 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.14 
 
 		 388 aa  315  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.53 
 
 		 377 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  51.06 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  47.31 
 
 		 374 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  47.57 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  49.73 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  49.33 
 
 		 380 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  48.21 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.9 
 
 		 367 aa  279  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  47.73 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.63 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.35 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04350  aminomethyltransferase, mitochondrial precursor, putative  42.67 
 
 		 409 aa  276  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.716927  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  41.22 
 
 		 414 aa  269  7e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  46.17 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  46.44 
 
 		 392 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01198  hypothetical glycine cleavage system T protein (Eurofung)  40.69 
 
 		 480 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.19 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3526  glycine cleavage system T protein  49.6 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  41.5 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  40.56 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  40.16 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0395  glycine cleavage system T protein  41.94 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  41.67 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  38.5 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  41.24 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.46 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.14 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.54 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.14 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  38.89 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  38.8 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  38.92 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.59 
 
 		 372 aa  242  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.61 
 
 		 360 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.14 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  36.39 
 
 		 393 aa  240  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  40.69 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  38.73 
 
 		 389 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  43.03 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  36.9 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.42 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  40.76 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  39.89 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  39.9 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>