More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0786 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 360 aa  734    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1403  glycine cleavage system T protein  63.61 
 
 		 376 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  66.3 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  59.32 
 
 		 367 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  58.99 
 
 		 360 aa  434  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  57.63 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  45.1 
 
 		 366 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  45.73 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0395  glycine cleavage system T protein  45.73 
 
 		 363 aa  308  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  45.81 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  44.97 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0375  glycine cleavage system T protein  44.82 
 
 		 362 aa  292  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  43.33 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  41.85 
 
 		 370 aa  255  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.6 
 
 		 375 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.27 
 
 		 374 aa  252  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.74 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.64 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.9 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  38.38 
 
 		 364 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  38.9 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  40.17 
 
 		 366 aa  248  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  37.46 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  43.49 
 
 		 384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.38 
 
 		 365 aa  246  6e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 		 372 aa  245  8e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.78 
 
 		 430 aa  244  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.06 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  40.62 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  38.44 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  35.08 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  39.51 
 
 		 381 aa  239  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.8 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.75 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  38.52 
 
 		 373 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  38.52 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  40.22 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  42.24 
 
 		 350 aa  236  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  38.95 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.38 
 
 		 362 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  41.34 
 
 		 364 aa  235  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.35 
 
 		 374 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  34.45 
 
 		 360 aa  235  9e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  39.58 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  38.75 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  40.17 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  41.4 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.21 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.22 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  41.13 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.61 
 
 		 360 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  37.53 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.61 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.94 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  41.32 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.94 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.16 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.29 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.19 
 
 		 363 aa  229  7e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  37.12 
 
 		 360 aa  229  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  39.35 
 
 		 376 aa  228  9e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  40.18 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  37.43 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.5 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  37.81 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  38.58 
 
 		 381 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.3 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.19 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  42.18 
 
 		 381 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  40.22 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.46 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.22 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.67 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  40 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  38.33 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.29 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  36.71 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.57 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.57 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  40.41 
 
 		 391 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.67 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.28 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.28 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.73 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.25 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  36.16 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.48 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  40.5 
 
 		 372 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  39.07 
 
 		 376 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.04 
 
 		 382 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.63 
 
 		 364 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  37.33 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.28 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.3 
 
 		 365 aa  222  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.86 
 
 		 368 aa  223  6e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  38.92 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  35.59 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  38.67 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.65 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>