More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1952 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
378 aa  765    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  68.18 
 
 
378 aa  513  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  48.18 
 
 
385 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  51.21 
 
 
385 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 
385 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  46.19 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  34.33 
 
 
386 aa  192  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 
385 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
378 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
390 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
373 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
381 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
382 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
394 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
390 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
395 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
390 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
500 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
500 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
394 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
492 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.79 
 
 
390 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
394 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
387 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  32.16 
 
 
394 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.87 
 
 
390 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.87 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
806 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
395 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.51 
 
 
390 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.51 
 
 
390 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.51 
 
 
390 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.51 
 
 
418 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.51 
 
 
433 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  31.07 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
383 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
390 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
376 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
816 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
805 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
815 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
388 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
405 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
392 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
392 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
385 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
388 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
381 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
390 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
390 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
390 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
376 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
390 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
390 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
385 aa  103  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
378 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
806 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 
378 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
393 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  28.29 
 
 
375 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
398 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 
419 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
801 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  28.05 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
365 aa  94  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1848  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.08 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
387 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  28.91 
 
 
371 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
393 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
386 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.97 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
827 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
394 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
383 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
401 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 
823 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
396 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>