More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3533 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
394 aa  790    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
390 aa  106  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
439 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
388 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
376 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
392 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
496 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
500 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
385 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.34 
 
 
433 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  22.8 
 
 
382 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
500 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.15 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
388 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  25.54 
 
 
447 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 
492 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 
392 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.3 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
816 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  24.62 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.99 
 
 
375 aa  86.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  25.62 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
816 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  24.59 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  25.69 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.81 
 
 
416 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 
799 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
812 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  22.14 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  23.96 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
819 aa  80.9  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  26.67 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
835 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  28.21 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  27.56 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
823 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.23 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
815 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.49 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.77 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.17 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
817 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  26.65 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.36 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
960 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  25.9 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  25.32 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
423 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.17 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
825 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
806 aa  76.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  30.3 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.23 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
445 aa  76.3  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.23 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  24.75 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 
394 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0244  D-amino-acid dehydrogenase  26.26 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.227624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  27.01 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.05 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.94 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  25.31 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>