More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  100 
 
 		 420 aa  825    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  70.53 
 
 		 416 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  71.53 
 
 		 415 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  66.67 
 
 		 419 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  68.12 
 
 		 424 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  65.48 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  65.48 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  65.48 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  66.92 
 
 		 419 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  61.95 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  56.69 
 
 		 419 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  53.11 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  51.29 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1087  FAD dependent oxidoreductase  51.92 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  52.09 
 
 		 482 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0955  D-amino-acid dehydrogenase  50.63 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249989 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  49.01 
 
 		 408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.56 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  31.44 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  27.19 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  32.52 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  32.37 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.59 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 432 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.61 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.98 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.47 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.88 
 
 		 433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.53 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.53 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.28 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.14 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.41 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  32.94 
 
 		 435 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.79 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  31.5 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.35 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.41 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0090  D-amino-acid dehydrogenase  30.59 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0071  D-amino-acid dehydrogenase  30.59 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  27.61 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.9 
 
 		 433 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.45 
 
 		 434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.98 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0131  D-amino-acid dehydrogenase  31.04 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.814059  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.74 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.6 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.47 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.47 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.73 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.06 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.47 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.02 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.47 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.47 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1813  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.24 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.24 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.51 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.51 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5009  D-amino-acid dehydrogenase  30.66 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.51 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.61 
 
 		 416 aa  146  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 411 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 415 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.73 
 
 		 417 aa  145  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  28.54 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.27 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  28.64 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  29.95 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.27 
 
 		 418 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  29.41 
 
 		 422 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0148  D-amino-acid dehydrogenase  31.63 
 
 		 445 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.739629  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  28.89 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.92 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.92 
 
 		 421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  26.05 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.9 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.9 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.02 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2982  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.29 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.33 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.11 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.19 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  28.3 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.33 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.33 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.91 
 
 		 436 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>