More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5297 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  100 
 
 		 443 aa  904    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  72.62 
 
 		 444 aa  634  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  51.68 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  52.67 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 		 442 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  50.91 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  51.03 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  45.09 
 
 		 431 aa  358  7e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 		 430 aa  358  8e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  44.58 
 
 		 442 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  46.03 
 
 		 447 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  45.12 
 
 		 447 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 442 aa  346  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 443 aa  342  9e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  44.63 
 
 		 430 aa  339  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  41.26 
 
 		 460 aa  335  9e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  43.12 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  41.82 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 439 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 		 441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  38.99 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  41.3 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  38.85 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 		 442 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  39.35 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  40.09 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 		 441 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 		 441 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 441 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  40.91 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  35.96 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  33.95 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  35.96 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 442 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 446 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 444 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 444 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 444 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 446 aa  243  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 455 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 428 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 799 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.71 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.94 
 
 		 369 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 819 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.25 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.18 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.18 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.72 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.72 
 
 		 369 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.24 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.24 
 
 		 369 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.48 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 823 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 389 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 		 816 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>