More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1296 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
401 aa  798    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  88.28 
 
 
398 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  77.39 
 
 
399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  77.97 
 
 
398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  77.72 
 
 
398 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  77.97 
 
 
398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 
394 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
376 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
382 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
392 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
500 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
500 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
496 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
385 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.19 
 
 
386 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
382 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 
381 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
385 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
385 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
388 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
390 aa  145  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 
378 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
492 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
400 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
442 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
387 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 
373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
819 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  26.5 
 
 
413 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
413 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
385 aa  123  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
816 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
816 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 
395 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 
413 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
815 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 
397 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  28.82 
 
 
394 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.25 
 
 
431 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  26.91 
 
 
412 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
413 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 
391 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.17 
 
 
460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.42 
 
 
417 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
446 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
805 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
815 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.55 
 
 
414 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
439 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.03 
 
 
423 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  27.84 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
815 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
392 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
812 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  26.43 
 
 
443 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
843 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.68 
 
 
417 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  31.43 
 
 
398 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  25.7 
 
 
416 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  25.7 
 
 
416 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  26.04 
 
 
446 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.59 
 
 
406 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.92 
 
 
433 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
413 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
376 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.99 
 
 
417 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
378 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.17 
 
 
416 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.19 
 
 
390 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  25.52 
 
 
415 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.52 
 
 
415 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.92 
 
 
418 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  27.29 
 
 
447 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 
413 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.19 
 
 
390 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.19 
 
 
390 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.19 
 
 
390 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.92 
 
 
418 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
390 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
413 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
825 aa  106  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.27 
 
 
390 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.13 
 
 
416 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 
378 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
376 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.85 
 
 
417 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.39 
 
 
415 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>