More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0765 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 442 aa  889    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  50.23 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  46.17 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  46.47 
 
 		 442 aa  405  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  46.31 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  44.99 
 
 		 439 aa  356  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 		 441 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  46.01 
 
 		 447 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  45.65 
 
 		 447 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 441 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  42.43 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  43.46 
 
 		 441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  45.88 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  42.01 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 442 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  40.87 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  44.58 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  42.54 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  45.91 
 
 		 443 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  45.48 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  44.6 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 		 430 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 466 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  44.06 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  43.36 
 
 		 441 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  40.84 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 431 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  37.3 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  37 
 
 		 442 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  37.3 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  37.3 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  37.3 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  37.3 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  37.3 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  36.6 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  33.56 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 		 446 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 471 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 394 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 392 aa  130  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 391 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.64 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.59 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.53 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 		 500 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>