More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0161 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  78.43 
 
 		 394 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 394 aa  797    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  77.66 
 
 		 394 aa  627  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  71.14 
 
 		 395 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.33 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 399 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 398 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 381 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 496 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 500 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 390 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 823 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 377 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  26.91 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 843 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 812 aa  119  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 819 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 827 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  28.26 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 492 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 815 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 816 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 817 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 816 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.38 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 825 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 815 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.49 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.68 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 799 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2266  putative sarcosine oxidase, beta subunit  26.63 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  23.9 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 413 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  23.91 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.21 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  29.27 
 
 		 822 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4046  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.39 
 
 		 457 aa  103  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.37 
 
 		 838 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 806 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>