More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5298 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
441 aa  886    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  59.64 
 
 
445 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  53.12 
 
 
439 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  51.03 
 
 
460 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 
442 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  50.23 
 
 
441 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  51.71 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  51.15 
 
 
441 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  50.7 
 
 
441 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  50.93 
 
 
441 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  50.81 
 
 
445 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  51.27 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  51.27 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  51.27 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  51.15 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  53.01 
 
 
466 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  51.61 
 
 
441 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  50.92 
 
 
441 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  51.04 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  50.69 
 
 
441 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  47.24 
 
 
442 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  51.74 
 
 
442 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
441 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 
441 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  49.77 
 
 
441 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  42.12 
 
 
442 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  41.99 
 
 
442 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  43.96 
 
 
444 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  43.74 
 
 
443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  42.66 
 
 
447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 
433 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 
446 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  41.74 
 
 
447 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 
451 aa  299  8e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  42.6 
 
 
443 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  39.68 
 
 
430 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 
430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
431 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 
431 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  41.06 
 
 
447 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 
430 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  35.43 
 
 
446 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 
446 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  33.56 
 
 
442 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
442 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 
446 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
442 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  33.87 
 
 
442 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
442 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  33.87 
 
 
442 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  33.87 
 
 
442 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  34.05 
 
 
436 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 
444 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
444 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 
444 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 
444 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
444 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
423 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
428 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
382 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
394 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
385 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
389 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 
496 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 
500 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
392 aa  123  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.7 
 
 
384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 
500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
383 aa  120  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
377 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
492 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.27 
 
 
380 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
395 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
395 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
394 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
385 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 
373 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
394 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
385 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
385 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 
382 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
399 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
388 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
389 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
397 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
385 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
387 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 
394 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>