More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0236 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  100 
 
 		 447 aa  893    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  98.43 
 
 		 447 aa  883    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  88.37 
 
 		 447 aa  747    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  49 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  46.12 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  46.03 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  45.6 
 
 		 442 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 446 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  45.35 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  44.25 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  45.35 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  38.72 
 
 		 460 aa  312  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  40.09 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 		 443 aa  306  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  42.96 
 
 		 441 aa  302  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 439 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  41.97 
 
 		 441 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  39.67 
 
 		 445 aa  289  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 		 431 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 430 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 441 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 441 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  41.96 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  38.8 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  41.95 
 
 		 441 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 441 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 442 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  38.89 
 
 		 442 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  38.89 
 
 		 442 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 442 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  38.89 
 
 		 442 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  38.89 
 
 		 442 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 442 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  38.41 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  38.99 
 
 		 466 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  40.74 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  38.52 
 
 		 446 aa  256  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 444 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 455 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 446 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 423 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 390 aa  136  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  30.44 
 
 		 380 aa  133  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.04 
 
 		 384 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 392 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.43 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 374 aa  123  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5602  AgaE protein, conversion of agropinic acid to mannopinic acid  46.77 
 
 		 134 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592638  hitchhiker  0.00552874 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 819 aa  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 		 382 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.06 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 378 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 388 aa  113  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 816 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 816 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4046  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.67 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>