More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0459 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
430 aa  880    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  78.14 
 
 
430 aa  672    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  76.74 
 
 
430 aa  675    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  71.86 
 
 
431 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  66.28 
 
 
430 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  61.16 
 
 
431 aa  524  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  43.02 
 
 
442 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  44.92 
 
 
443 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  43.95 
 
 
442 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 
444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 
442 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 
442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  39.76 
 
 
460 aa  325  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 
433 aa  323  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  40.09 
 
 
447 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 
443 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 
447 aa  299  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 
447 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 
443 aa  282  7.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
441 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 
441 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 
441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 
439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
445 aa  268  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  35.78 
 
 
445 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 
441 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 
451 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
442 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
446 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  35.88 
 
 
441 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  35.58 
 
 
436 aa  249  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  35.8 
 
 
446 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 
441 aa  246  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 
441 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 
441 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
442 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  34.65 
 
 
442 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
441 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  34.42 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  34.42 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  34.42 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  36.9 
 
 
441 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
441 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
441 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 
446 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
441 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 
466 aa  236  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 
444 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 
441 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
455 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
471 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
423 aa  200  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
428 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
392 aa  133  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
387 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
385 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
378 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 
390 aa  123  7e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
378 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.62 
 
 
386 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
394 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
394 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.39 
 
 
384 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.6 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.6 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
381 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
376 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 
382 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
492 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  23.87 
 
 
390 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
394 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.56 
 
 
369 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.56 
 
 
369 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
378 aa  107  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.78 
 
 
369 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.11 
 
 
369 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 
393 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 
816 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
383 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.43 
 
 
369 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>