More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8165 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  100 
 
 		 460 aa  939    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  51.35 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  48.94 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  51.03 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  46.17 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  45.75 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  46.42 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  47.41 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  48.5 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  47.34 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  45.24 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  47.54 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  48.03 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  44.06 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  46.31 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  46.31 
 
 		 442 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  46.62 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 		 441 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 441 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 		 466 aa  345  8e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  42.47 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  38.05 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  41.26 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 430 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 		 433 aa  302  7.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 451 aa  300  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  38.72 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 430 aa  286  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 431 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  39.67 
 
 		 447 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  34.01 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 446 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 446 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  32.89 
 
 		 442 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  32.66 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  32.66 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  32.66 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  33.18 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 444 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 444 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 984 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 413 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 816 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 983 aa  113  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 395 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.6 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 799 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.43 
 
 		 857 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 816 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.7 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  26.79 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 394 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>