More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6497 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  100 
 
 		 380 aa  760    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  58.65 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  57.72 
 
 		 376 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  56.33 
 
 		 377 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  54.81 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  54.81 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  53.41 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  55.28 
 
 		 375 aa  362  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  51.07 
 
 		 383 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  54.74 
 
 		 375 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  54.07 
 
 		 382 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  53.81 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  56.91 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  54.47 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  45.5 
 
 		 376 aa  301  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  52.97 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 378 aa  296  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  46.19 
 
 		 389 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 389 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  45.15 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  45.7 
 
 		 394 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  43.67 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  46.01 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  45.82 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 388 aa  212  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  35.66 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  34.15 
 
 		 390 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  29.21 
 
 		 447 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 423 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  29.09 
 
 		 446 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 447 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 823 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 496 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 960 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 444 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  27.27 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 444 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 983 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  30.34 
 
 		 442 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  30.1 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  30.1 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  30.1 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 442 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  28.57 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 441 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 441 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 431 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  29.61 
 
 		 436 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 984 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>