More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4345 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  754    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  58.86 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  46.17 
 
 		 377 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  45.95 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  41.62 
 
 		 390 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  41.87 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  40.87 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.74 
 
 		 384 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 391 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 389 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 383 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 383 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 389 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 376 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  33.8 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 384 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 492 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  33.62 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 983 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 984 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 500 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 500 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 960 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 383 aa  142  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  30.3 
 
 		 380 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.07 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 385 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 381 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 395 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.73 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.4 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2636  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.1 
 
 		 416 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  27.95 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1949  sarcosine oxidase, beta subunit  26.39 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  29.56 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  29.56 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  26.19 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.08 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  29.41 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 383 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  29.56 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.21 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.21 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1936  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.59 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1654  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.3 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  28.45 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.23 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.35 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.67 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1577  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.04 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2366  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.79 
 
 		 417 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 446 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>