More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2505 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  83.06 
 
 		 378 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 		 381 aa  777    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 		 381 aa  777    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  96.85 
 
 		 381 aa  756    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  60.7 
 
 		 381 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  58.98 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  56.03 
 
 		 375 aa  398  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  42.45 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  42.52 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  45.36 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  45.89 
 
 		 377 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  43.54 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  43.7 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  43.42 
 
 		 376 aa  270  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  38.56 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  40.05 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  37.88 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  37.4 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  40 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 379 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  39.05 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  36.69 
 
 		 391 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  34.54 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  34.54 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  34.17 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  36.05 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  34.54 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  34.54 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  34.12 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  33.86 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  33.86 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  33.86 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  33.86 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  33.06 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  34.17 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  36.02 
 
 		 395 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  34.29 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  35.16 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  32.71 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  37.67 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  37.6 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  35.84 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  34.48 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  31.42 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  31.03 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  34.15 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.42 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  32.63 
 
 		 392 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  32.25 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  27.2 
 
 		 452 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  31.05 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  30.23 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  24.68 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  29.4 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 389 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 500 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 394 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 500 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 496 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  29.24 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 401 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 374 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 382 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>