More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3081 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  83.06 
 
 
381 aa  641    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  83.06 
 
 
381 aa  641    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  100 
 
 
378 aa  766    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  81.99 
 
 
381 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  57.82 
 
 
381 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  56.68 
 
 
379 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  55.59 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  44.85 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1288  Sarcosine oxidase  40.94 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  42.36 
 
 
381 aa  279  6e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  43.24 
 
 
377 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  41.67 
 
 
443 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  41.99 
 
 
428 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  37.08 
 
 
385 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  40.91 
 
 
376 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  40.9 
 
 
391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  39.16 
 
 
389 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  38.22 
 
 
386 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  37.5 
 
 
390 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  39.04 
 
 
390 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  37.33 
 
 
379 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  33.78 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  36.81 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  33.78 
 
 
372 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 
379 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  33.78 
 
 
372 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  33.78 
 
 
372 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  33.78 
 
 
372 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  32.53 
 
 
373 aa  206  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  32.89 
 
 
372 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  32.63 
 
 
372 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  32.63 
 
 
372 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  34.9 
 
 
371 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  32.63 
 
 
372 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  32.63 
 
 
372 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  32.63 
 
 
372 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  32.63 
 
 
372 aa  202  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  32.63 
 
 
372 aa  202  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  32.63 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  32.45 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  32.45 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  32.45 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  34.02 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  32.59 
 
 
372 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  33.68 
 
 
391 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  33.42 
 
 
391 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  39.89 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
384 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  34.37 
 
 
391 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3775  sarcosine oxidase, putative  31.59 
 
 
382 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000086866 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1558  sarcosine oxidase  32.63 
 
 
394 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6193  Sarcosine oxidase  34.68 
 
 
352 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4345  Sarcosine oxidase  33.24 
 
 
380 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
402 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2363  Sarcosine oxidase  33.87 
 
 
392 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182058  normal  0.337109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3521  Sarcosine oxidase  33.52 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34590  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.24 
 
 
399 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0115291  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47550  predicted protein  30.43 
 
 
452 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3930  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 
355 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  30.57 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1845  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  29.53 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3678  Sarcosine oxidase  30.5 
 
 
376 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  25.51 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
395 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
376 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0077  sarcosine oxidase  29.72 
 
 
366 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
394 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1492  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4128  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 
389 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
399 aa  89.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  30.08 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
428 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02786  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 
428 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
400 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
389 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>