More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1833 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  100 
 
 		 378 aa  779    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  52.21 
 
 		 376 aa  346  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  50.67 
 
 		 385 aa  345  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  48.08 
 
 		 385 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  46.74 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  48.3 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 		 383 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  47.16 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  45.5 
 
 		 369 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  46.86 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  45.08 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  47.01 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  43.68 
 
 		 390 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  45.9 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  45.63 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  45.63 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  44.41 
 
 		 371 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  45.23 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  41.62 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  40.68 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 		 375 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  38.52 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  39.66 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.18 
 
 		 384 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 984 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.27 
 
 		 417 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.32 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.21 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 390 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 983 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.29 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.06 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.58 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 960 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.73 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.06 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.29 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.29 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.57 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  30.24 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.93 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.71 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 401 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  29.03 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  26.38 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.67 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  26.29 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 382 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  26.02 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 377 aa  90.1  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  26.02 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  26.02 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  26.91 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  26.47 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  24.71 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  27.42 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  25.75 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>