More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0151 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  94.34 
 
 		 384 aa  690    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 389 aa  795    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  83.65 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  64.78 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  56.91 
 
 		 389 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  57.45 
 
 		 389 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  54.38 
 
 		 378 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  53.6 
 
 		 376 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  54.3 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 		 385 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 394 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  42.78 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 		 376 aa  288  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  48.1 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  44.41 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  44.41 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  44.96 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  46.01 
 
 		 378 aa  269  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  45.95 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  44.96 
 
 		 375 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  44.14 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  44.14 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  37.05 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  38.38 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  43.58 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  43.64 
 
 		 383 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  34.5 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 374 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 376 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 442 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 983 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 984 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 382 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 441 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.33 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 442 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  27.64 
 
 		 442 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  27.64 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  27.64 
 
 		 442 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  27.64 
 
 		 442 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 442 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  29.06 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 960 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 441 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  26 
 
 		 460 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 385 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 441 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  30.71 
 
 		 822 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 500 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 500 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 816 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  28.89 
 
 		 369 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  27.73 
 
 		 446 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  28.73 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 455 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 444 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  27.99 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  28.45 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  26.23 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  28.42 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>