More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0048 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
376 aa  757    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  57.26 
 
 
378 aa  418  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  56.72 
 
 
389 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 
389 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  56.03 
 
 
389 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  56.6 
 
 
391 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  52.69 
 
 
394 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  53.33 
 
 
384 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  53.6 
 
 
389 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  44.15 
 
 
385 aa  300  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  43.24 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  45.5 
 
 
380 aa  282  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  44.71 
 
 
394 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  43.67 
 
 
377 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 
394 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 
376 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  43.31 
 
 
383 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  43.31 
 
 
383 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  45.95 
 
 
375 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  43.88 
 
 
378 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  42.26 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  44.5 
 
 
382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 
382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  45.17 
 
 
375 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 
384 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  44.99 
 
 
394 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  44.76 
 
 
383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
390 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  33.6 
 
 
390 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
386 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
393 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  33.51 
 
 
377 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
373 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
376 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
374 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
397 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
983 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
984 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
389 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
500 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
500 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
382 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
382 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
492 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
442 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 
396 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
442 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
401 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
441 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  26.05 
 
 
442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
388 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
392 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
385 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.86 
 
 
369 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.69 
 
 
391 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.69 
 
 
391 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.68 
 
 
417 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  22.22 
 
 
445 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.86 
 
 
369 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
385 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 
382 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.01 
 
 
386 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.27 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.81 
 
 
391 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.27 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.31 
 
 
369 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  28.44 
 
 
460 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.81 
 
 
391 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.81 
 
 
391 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
391 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
444 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
444 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.56 
 
 
391 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
441 aa  102  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
395 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25 
 
 
369 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
385 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
392 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
444 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 
387 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
428 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 
816 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25 
 
 
369 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
377 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.18 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.71 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.18 
 
 
369 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.5 
 
 
391 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>